Dicer |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1e/Mouse_dicer.jpg/250px-Mouse_dicer.jpg) |
Estructures disponibles |
---|
PDB | Cerca ortòloga: PDBe RCSB |
---|
Llista de codis id de PDB |
---|
2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ |
|
|
Identificadors |
---|
Àlies | DICER1 (HUGO), DCR1, Dicer, Dicer1e, HERNA, MNG1, RMSE2, K12H4.8-LIKE, dicer 1, ribonuclease III, GLOW |
---|
Identif. externs | OMIM: 606241 MGI: 2177178 HomoloGene: 13251 GeneCards: DICER1 OMA: DICER1 - orthologs |
---|
Localització del gen (humà) |
---|
![Cromosoma 14 (humà)](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/78/Ideogram_human_chromosome_14.svg/300px-Ideogram_human_chromosome_14.svg.png) | Crom. | Cromosoma 14 (humà)[1] |
---|
| Banda | 14q32.13 | Inici | 95.086.228 bp[1] |
---|
Fi | 95.158.010 bp[1] |
---|
|
Localització del gen (ratolí) |
---|
![Cromosoma 12 (ratolí)](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/ca/Ideogram_house_mouse_chromosome_12.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_12.svg.png) | Crom. | Cromosoma 12 (ratolí)[2] |
---|
| Banda | 12 E|12 54.83 cM | Inici | 104.654.001 bp[2] |
---|
Fi | 104.718.211 bp[2] |
---|
|
Patró d'expressió d'ARN |
---|
Bgee | humà | ratolí (ortòleg) |
---|
Més explicacions | - tail of epididymis
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- caput epididymis
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- nervi òptic
- os esponjós
- corpus epididymis
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- mucosa of paranasal sinus
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- visceral pleura
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- cavitat oral
![Podeu corregir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg/10px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg.png)
- parietal pleura
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- inferior ganglion of vagus nerve
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
|
| Més explicacions | - zigot
- secondary oocyte
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- primary oocyte
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- tail of embryo
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- genital tubercle
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- mandibular prominence
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- medullary collecting duct
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- corpuscle renal
- abdominal wall
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
- primitive streak
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png)
|
| Més referències a dades d'expressió |
|
---|
BioGPS | |
---|
|
Ontologia genètica |
---|
Funció molecular | - unió de nucleòtids
![Podeu corregir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg/10px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg.png) - helicase activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - protein domain specific binding
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - pre-miRNA binding
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - metal ion binding
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - endoribonuclease activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - unió proteica
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) - siRNA binding
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - RNA binding
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - nuclease activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - double-stranded RNA binding
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - endonuclease activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - activitat hidrolasa
![Podeu corregir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg/10px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg.png) - unió d'ATP
![Podeu corregir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg/10px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg.png) - ribonuclease III activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - DNA binding
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - deoxyribonuclease I activity
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) | Component cel·lular | - citoplasma
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) - citosol
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) - Complex de silenciament induït per ARN
![Podeu corregir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg/10px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg.png) - growth cone
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - ARC complex
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - RISC-loading complex
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - axó
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) - dendrita
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) - nucli cel·lular
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) - endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - exosoma extracel·lular
![Podeu corregir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg/10px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors.svg.png) | Procés biològic | - neuron projection morphogenesis
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - RNA processing
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - negative regulation of transcription by RNA polymerase II
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - peripheral nervous system myelin formation
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - pre-miRNA processing
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - positive regulation of myelination
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - nerve development
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - positive regulation of Schwann cell differentiation
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - negative regulation of Schwann cell proliferation
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - miRNA metabolic process
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - production of siRNA involved in RNA interference
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - silenciament gènic
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f6/Wiki_article_small_light.svg/10px-Wiki_article_small_light.svg.png) - apoptotic DNA fragmentation
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - negative regulation of tumor necrosis factor production
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - NIK/NF-kappaB signaling
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - negative regulation of gene expression
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) - tube formation
![Podeu traduir-lo](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg/17px-OOjs_UI_icon_Wikidata_Echo_lightcolors_en.svg.png) | Fonts:Amigo / QuickGO |
|
Ortòlegs |
---|
Espècies | Humà | Ratolí |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (ARNm) | |
---|
NM_001195573 NM_001271282 NM_001291628 NM_030621 NM_177438 |
| |
---|
RefSeq (proteïna) | |
---|
NP_001182502 NP_001258211 NP_001278557 NP_085124 NP_803187 |
| |
---|
Localització (UCSC) | Chr 14: 95.09 – 95.16 Mb | Chr 12: 104.65 – 104.72 Mb |
---|
Cerca a PubMed | [3] | [4] |
---|
|
Wikidata |
Veure/Editar gen humà | Veure/Editar gen del ratolí |
|
Dicer és una ribonucleasa membre de la família de les ARNasa III. És una gran proteïna (>200 kD) monomèrica present en el citoplasma cel·lular. Dicer catalitza el primer pas del mecanisme de RNAi: converteix ARN doble banda (ARNdb o dsRNA) i premicroARN (pre-miARN) en fragments d'ARN d'interferència petits anomenats ARNip (siRNAs i miRNAs) de 20-25 nucleòtids, amb dues bases lliures als extrems 3' hidroxil i un extrem 5' fosfat.
El nom Dicer fou donat per Emily Bernstein, qui fou la primera a demostrar l'activitat catalítica d'ARNdb de l'enzima.
Les enzimes Dicer contenen:
- un domini ATPasa/ARN helicasa a l'extrem N-terminal
- un domini DUF283 de funció desconeguda
- un domini PAZ, responsable del reconeixement dels nucleòtids lliures a l'extrem 3'
- dos dominis catalítics ARNasa III (RIIIa i RIIIb) que constitueixen el centre actiu
- un domini dsRBD (en anglès: double strand RNA binding domain) a l'extrem C-terminal
Cadascun dels dominis ARNasa talla una cadena d'ARN de manera polaritzada: el domini RIIIb talla la cadena ascendent del dsRNA, que conté el 5' fosfat, mentre que el domini RIIIa talla la cadena descendent, que conté l'extrem 3' OH. El domini RIIIa mesura la distància al lloc de tall del dsRNA, potser amb l'ajuda del domini PAZ. Per aquest motiu, el dsRNA es talla a una distància aproximada de 20 parells de bases contades des de l'extrem de la molècula: l'hèlix entre el domini PAZ i el domini RIIIa mesura 65 àngstroms, que corresponen a dues voltes d'hèlix de dsRNA.
- ↑ 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100697 - Ensembl, May 2017
- ↑ 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041415 – Ensembl, May 2017
- ↑ «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ↑ «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.