La saison 2006 du Championnat de Guinée-Bissau de football est la vingt-huitième édition de la Primeira Divisião, le championnat de première division en Guinée-Bissau. Les douze meilleures équipes du pays se retrouvent au sein d'une poule unique où elles s'affrontent à deux reprises. En fin de saison, les trois derniers du classement sont relégués et remplacés par les trois meilleurs clubs de Segunda Divisão.
C'est le CF Os Balantas qui remporte la compétition cette saison après avoir terminé invaincu en tête du classement final, avec cinq points d'avance sur le Mavegro Futebol Clube et dix-sept sur l'ADR Mansaba, club promu de D2. C'est le second titre de champion de Guinée-Bissau de l'histoire du club.
Les saisons grisées sont celles où le championnat ne s'est pas disputé (ou, pour 1995, où le titre n'a pas été attribué). Pour les saisons avant 1991 et celles en noir, des informations sont manquantes (voir le palmarès)
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Championnats nationaux de première division 2005-2006 à travers le monde