SOX2

SOX2
사용 가능한 구조
PDB동원체 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록

1O4X, 2LE4

식별자
다른 이름SOX2, ANOP3, MCOPS3, SRY-box 2, Sox2, SRY-box transcription factor 2
외부 IDOMIM: 184429 MGI: 98364 HomoloGene: 68298 GeneCards: SOX2
유전자 위치 (인간)
3번 염색체
염색체3번 염색체[1]
3번 염색체
SOX2의 유전자 위치
SOX2의 유전자 위치
자리3q26.33시작181,711,925 bp[1]
181,714,436 bp[1]
유전자 위치 ()
3번 염색체 (쥐)
염색체3번 염색체 (쥐)[2]
3번 염색체 (쥐)
SOX2의 유전자 위치
SOX2의 유전자 위치
자리3 A3|3 16.93 cM시작34,704,554 bp[2]
34,706,610 bp[2]
RNA 발현 패턴
Bgee
인간(동원체)
최상위 발현
  • ventricular zone

  • bronchial epithelial cell

  • ganglionic eminence

  • external globus pallidus

  • pars reticulata

  • dorsal motor nucleus of vagus nerve

  • 배쪽 피개부

  • superior vestibular nucleus

  • oral cavity

  • subthalamic nucleus
최상위 발현
  • medial ganglionic eminence

  • tooth germ

  • Enamel organ

  • Rostral migratory stream

  • 시교차 상핵

  • vestibular sensory epithelium

  • ventricular zone

  • lateral septal nucleus

  • 혀의 윗면

  • median eminence
추가 참조 발현 데이터
BioGPS


추가 참조 발현 데이터
유전자 온톨로지
분자 함수
  • DNA 결합
  • sequence-specific DNA binding
  • miRNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • transcription cis-regulatory region binding
  • 단백질 결합
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
세포 성분
  • 세포질
  • 세포액
  • transcription regulator complex
  • 핵질
  • 세포핵
생물학적 과정
  • eye development
  • pituitary gland development
  • DNA를 주형으로 한 전사의 조절
  • negative regulation of neuron differentiation
  • somatic stem cell population maintenance
  • endodermal cell fate specification
  • positive regulation of cell-cell adhesion
  • tissue regeneration
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • chromatin organization
  • transcription by RNA polymerase II
  • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
  • adenohypophysis development
  • DNA를 주형으로 한 전사
  • neuronal stem cell population maintenance
  • positive regulation of transcription, DNA-templated
  • multicellular organism development
  • glial cell fate commitment
  • response to wounding
  • osteoblast differentiation
  • positive regulation of cell differentiation
  • negative regulation of epithelial cell proliferation
  • 유전자 발현의 조절
  • inner ear development
  • forebrain development
  • response to growth factor
  • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway
  • positive regulation of MAPK cascade
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • cytokine-mediated signaling pathway
  • 세포 분화
  • cell fate commitment
  • central nervous system development
  • neuron differentiation
출처: Amigo / QuickGO
동원체
인간
앙트레

6657

20674

앙상블

ENSG00000181449

ENSMUSG00000074637

유니프롯

P48431

P48432

RefSeq (mRNA)

NM_003106

NM_011443

RefSeq(단백질)

NP_003097

NP_035573

위치(UCSC)Chr 3: 181.71 – 181.71 MbChr 3: 34.7 – 34.71 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집쥐 보기/편집

SOX2로도 알려진 SRY(성 결정 영역 Y)-박스 2(SRY (sex determining region Y)-box 2)는 미분화 배아줄기세포의 자가 재생 또는 다능성을 유지하는 데 필수적인 전사인자이다. Sox2는 배아 및 신경줄기세포의 유지에 중요한 역할을 한다.

Sox2는 포유류 발달의 여러 단계에서 중요한 역할을 하는 것으로 밝혀진 Sox 전사 인자 계열의 구성원이다. 이 단백질 계열은 약 80개의 아미노산을 포함하는 HMG(고이동성 그룹) 상자 도메인으로 알려진 고도로 보존된 DNA 결합 도메인을 공유한다.

Sox2는 재생 의학의 매우 유망한 분야인 유도 다능성과 관련된 연구에서 큰 가능성을 가지고 있다.

각주

  1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000181449 - 앙상블, May 2017
  2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000074637 - 앙상블, May 2017
  3. “Human PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》. 
  4. “Mouse PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》. 

외부 링크

  • Young Lab- Core Transcriptional Regulatory Circuitry in Human Embryonic Stem Cells
  • GeneReviews/NCBI/NIH/UW entry on SOX2-related eye disorders
  • Generating iPS Cells from MEFS through Forced Expression of Sox-2, Oct-4, c-Myc, and Klf4 (Journal of Visualized Experiments) Archived 2008년 4월 9일 - 웨이백 머신
  • GeneReviews/NCBI/NIH/UW entry on Anophthalmia / Microphthalmia Overview
  • 모든 구조 정보의 개요는 유니프롯PDB로 볼 수 있습니다: P48431 (Human Transcription factor SOX-2) - PDBe-KB.
  • 모든 구조 정보의 개요는 유니프롯PDB로 볼 수 있습니다: P48432 (Mouse Transcription factor SOX-2) - PDBe-KB.