Рибосомний білок S3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1WH9, 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 3J7P, 4UJE, 4D5L, 3J7R, 4UJD, 4V5Z, 5FLX, 4D61, 4UJC | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RPS3, S3, ribosomal protein S3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600454 MGI: 1350917 HomoloGene: 779 GeneCards: RPS3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • tubulin binding • DNA N-glycosylase activity • small ribosomal subunit rRNA binding • iron-sulfur cluster binding • transcription factor binding • oxidized purine DNA binding • Hsp70 protein binding • lyase activity • enzyme binding • mRNA binding • structural constituent of ribosome • damaged DNA binding • ubiquitin-like protein conjugating enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • oxidized pyrimidine DNA binding • endodeoxyribonuclease activity • protein kinase binding • supercoiled DNA binding • DNA binding • Hsp90 protein binding • microtubule binding • protein kinase A binding • RNA binding • kinase binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • class III/IV DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • Полісома • мембрана • focal adhesion • ruffle membrane • мітохондрія • цитоскелет • клітинне ядро • рибосома • ядерце • екзосома • клітинна мембрана • веретено поділу • мітохондріальний матрикс • small ribosomal subunit • mitotic spindle • мітохондріальна внутрішня мембрана • cytosolic small ribosomal subunit • нуклеоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • ендоплазматичний ретикулум • NF-kappaB complex • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • Рибонуклеопротеїни • синапс |
---|
Біологічний процес | • chromosome segregation • positive regulation of endodeoxyribonuclease activity • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of microtubule polymerization • клітинний цикл • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of translation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • viral transcription • response to TNF agonist • positive regulation of apoptotic signaling pathway • GO:0001306 response to oxidative stress • transcription, DNA-templated • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • positive regulation of DNA N-glycosylase activity • positive regulation of JUN kinase activity • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • negative regulation of DNA repair • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • поділ клітини • spindle assembly • negative regulation of protein ubiquitination • GO:1901313 positive regulation of gene expression • translational initiation • regulation of translation • cellular response to hydrogen peroxide • Біосинтез білків • positive regulation of base-excision repair • GO:0100026 Репарація ДНК • regulation of apoptotic process • rRNA processing • cytoplasmic translation • positive regulation of protein-containing complex assembly • positive regulation of interleukin-2 production • positive regulation of activated T cell proliferation • positive regulation of T cell receptor signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • cellular response to tumor necrosis factor |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001260507 NM_001005 NM_001256802 NM_001260506 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_000996 NP_001243731 NP_001247435 NP_001247436 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 75.4 – 75.42 Mb | Хр. 7: 99.13 – 99.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
Рибосомний білок S3 (англ. Ribosomal protein S3) – білок, який кодується геном RPS3, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 26 688[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAVQISKKRK | | FVADGIFKAE | | LNEFLTRELA | | EDGYSGVEVR | | VTPTRTEIII |
LATRTQNVLG | | EKGRRIRELT | | AVVQKRFGFP | | EGSVELYAEK | | VATRGLCAIA |
QAESLRYKLL | | GGLAVRRACY | | GVLRFIMESG | | AKGCEVVVSG | | KLRGQRAKSM |
KFVDGLMIHS | | GDPVNYYVDT | | AVRHVLLRQG | | VLGIKVKIML | | PWDPTGKIGP |
KKPLPDHVSI | | VEPKDEILPT | | TPISEQKGGK | | PEPPAMPQPV | | PTA |
Цей білок за функціями належить до ліаз, рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.
Література
- Zhang X.T., Tan Y.M., Tan Y.H. (1990). Isolation of a cDNA encoding human 40S ribosomal protein s3. Nucleic Acids Res. 18: 6689—6689. PMID 2129557 DOI:10.1093/nar/18.22.6689
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tycowski K.T., Shu M.D., Steitz J.A. (1993). A small nucleolar RNA is processed from an intron of the human gene encoding ribosomal protein S3. Genes Dev. 7: 1176—1190. PMID 8319909 DOI:10.1101/gad.7.7a.1176
- Hegde V., Wang M., Deutsch W.A. (2004). Human ribosomal protein S3 interacts with DNA base excision repair proteins hAPE/Ref-1 and hOGG1. Biochemistry. 43: 14211—14217. PMID 15518571 DOI:10.1021/bi049234b
- Hegde V., Wang M., Deutsch W.A. (2004). Characterization of human ribosomal protein S3 binding to 7,8-dihydro-8-oxoguanine and abasic sites by surface plasmon resonance. DNA Repair. 3: 121—126. PMID 14706345 DOI:10.1016/j.dnarep.2003.10.004
- Jang C.Y., Lee J.Y., Kim J. (2004). RpS3, a DNA repair endonuclease and ribosomal protein, is involved in apoptosis. FEBS Lett. 560: 81—85. PMID 14988002 DOI:10.1016/S0014-5793(04)00074-2
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10420 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P23396 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
підрозділ 40S | |
---|
|
---|
Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|