ACTL6B

Ідентифікатори

Символи

ACTL6B, ACTL6, BAF53B, arpNalpha, actin like 6B, EIEE76, IDDSSAD, DEE76, SMARCN2

Зовнішні ІД

OMIM: 612458 MGI: 1933548 HomoloGene: 81844 GeneCards: ACTL6B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural constituent of cytoskeleton • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • ядерце • nBAF complex • SWI/SNF complex • NuA4 histone acetyltransferase complex
Біологічний процес	• нейробіологія розвитку • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • spinal cord development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • ремоделювання хроматину • cytoskeleton organization • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • histone H4 acetylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51412


83766

Ensembl


ENSG00000077080


ENSMUSG00000029712

UniProt


O94805


Q99MR0

RefSeq (мРНК)


NM_016188


NM_031404

RefSeq (білок)


NP_057272


NP_113581

Локус (UCSC)

Хр. 7: 100.64 – 100.66 Mb

Хр. 5: 137.55 – 137.57 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ACTL6B (англ. Actin like 6B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 46 877^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGGVYGGDE	VGALVFDIGS	FSVRAGYAGE	DCPKADFPTT	VGLLAAEEGG
GLELEGDKEK	KGKIFHIDTN	ALHVPRDGAE	VMSPLKNGMI	EDWECFRAIL
DHTYSKHVKS	EPNLHPVLMS	EAPWNTRAKR	EKLTELMFEQ	YNIPAFFLCK
TAVLTAFANG	RSTGLVLDSG	ATHTTAIPVH	DGYVLQQGIV	KSPLAGDFIS
MQCRELFQEM	AIDIIPPYMI	AAKEPVREGA	PPNWKKKEKL	PQVSKSWHNY
MCNEVIQDFQ	ASVLQVSDSP	YDEQVAAQMP	TVHYEMPNGY	NTDYGAERLR
IPEGLFDPSN	VKGLSGNTML	GVGHVVTTSI	GMCDIDIRPG	LYGSVIVTGG
NTLLQGFTDR	LNRELSQKTP	PSMRLKLIAS	NSTMERKFSP	WIGGSILASL
GTFQQMWISK	QEYEEGGKQC	VERKCP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

Harata M., Mochizuki R., Mizuno S. (1999). Two isoforms of a human actin-related protein show nuclear localization and mutually selective expression between brain and other tissues. Biosci. Biotechnol. Biochem. 63: 917—923. PMID 10380635 DOI:10.1271/bbb.63.917
Olave I., Wang W., Xue Y., Kuo A., Crabtree G.R. (2002). Identification of a polymorphic, neuron-specific chromatin remodeling complex. Genes Dev. 16: 2509—2517. PMID 12368262 DOI:10.1101/gad.992102
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:160 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O94805 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 7 вересня 2017.