ANKZF1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ANKZF1, ain containing 1, ankz8, ZNF744, ankyrin repeat and zinc finger domain containing 1, Vms1, ankyrin repeat and zinc finger peptidyl tRNA hydrolase 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 617541 MGI: 1098746 HomoloGene: 41225 GeneCards: ANKZF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding |
---|
Клітинна компонента | • Cdc48p-Npl4p-Vms1p AAA ATPase complex • мембрана • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • nuclear protein quality control by the ubiquitin-proteasome system • mitochondria-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent ERAD pathway • cellular response to hydrogen peroxide |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001042410 NM_001282792 NM_018089 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001035869 NP_001269721 NP_060559 |
| NP_001254549 NP_080463 NP_001391832 NP_001391833 NP_001391834
| NP_001391835 NP_001391836 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 219.23 – 219.24 Mb | Хр. 1: 75.17 – 75.18 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ANKZF1 (англ. Ankyrin repeat and zinc finger domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 726 амінокислот, а молекулярна маса — 80 927[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSPAPDAAPA | | PASISLFDLS | | ADAPVFQGLS | | LVSHAPGEAL | | ARAPRTSCSG |
SGERESPERK | | LLQGPMDISE | | KLFCSTCDQT | | FQNHQEQREH | | YKLDWHRFNL |
KQRLKDKPLL | | SALDFEKQSS | | TGDLSSISGS | | EDSDSASEED | | LQTLDRERAT |
FEKLSRPPGF | | YPHRVLFQNA | | QGQFLYAYRC | | VLGPHQDPPE | | EAELLLQNLQ |
SRGPRDCVVL | | MAAAGHFAGA | | IFQGREVVTH | | KTFHRYTVRA | | KRGTAQGLRD |
ARGGPSHSAG | | ANLRRYNEAT | | LYKDVRDLLA | | GPSWAKALEE | | AGTILLRAPR |
SGRSLFFGGK | | GAPLQRGDPR | | LWDIPLATRR | | PTFQELQRVL | | HKLTTLHVYE |
EDPREAVRLH | | SPQTHWKTVR | | EERKKPTEEE | | IRKICRDEKE | | ALGQNEESPK |
QGSGSEGEDG | | FQVELELVEL | | TVGTLDLCES | | EVLPKRRRRK | | RNKKEKSRDQ |
EAGAHRTLLQ | | QTQEEEPSTQ | | SSQAVAAPLG | | PLLDEAKAPG | | QPELWNALLA |
ACRAGDVGVL | | KLQLAPSPAD | | PRVLSLLSAP | | LGSGGFTLLH | | AAAAAGRGSV |
VRLLLEAGAD | | PTVQDSRARP | | PYTVAADKST | | RNEFRRFMEK | | NPDAYDYNKA |
QVPGPLTPEM | | EARQATRKRE | | QKAARRQREE | | QQQRQQEQEE | | REREEQRRFA |
ALSDREKRAL | | AAERRLAAQL | | GAPTSPIPDS | | AIVNTRRCWS | | CGASLQGLTP |
FHYLDFSFCS | | TRCLQDHRRQ | | AGRPSS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Stapf C., Cartwright E., Bycroft M., Hofmann K., Buchberger A. (2011). The general definition of the p97/valosin-containing protein (VCP)-interacting motif (VIM) delineates a new family of p97 cofactors. J. Biol. Chem. 286: 38670—38678. PMID 21896481 DOI:10.1074/jbc.M111.274472
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25527 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H8Y5 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2018. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |