ATG12 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4GDK, 4GDL, 4NAW | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ATG12, APG12, APG12L, FBR93, HAPG12, autophagy related 12 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609608 MGI: 1914776 HomoloGene: 37953 GeneCards: ATG12 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • Atg8 ligase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • phagophore assembly site membrane • phagocytic vesicle membrane • Atg12-Atg5-Atg16 complex • мембрана • autophagosome • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • автофагія • autophagy of nucleus • C-terminal protein lipidation • autophagy of mitochondrion • macroautophagy • autophagosome assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 115.83 – 115.84 Mb | Хр. 18: 46.86 – 46.87 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ATG12 (англ. Autophagy related 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 140 амінокислот, а молекулярна маса — 15 113[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAEEPQSVLQ | | LPTSIAAGGE | | GLTDVSPETT | | TPEPPSSAAV | | SPGTEEPAGD |
TKKKIDILLK | | AVGDTPIMKT | | KKWAVERTRT | | IQGLIDFIKK | | FLKLVASEQL |
FIYVNQSFAP | | SPDQEVGTLY | | ECFGSDGKLV | | LHYCKSQAWG |
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- Mizushima N., Sugita H., Yoshimori T., Ohsumi Y. (1998). A new protein conjugation system in human. The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy. J. Biol. Chem. 273: 33889—33892. PMID 9852036 DOI:10.1074/jbc.273.51.33889
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
- Tanida I., Nishitani T., Nemoto T., Ueno T., Kominami E. (2002). Mammalian Apg12p, but not the Apg12p.Apg5p conjugate, facilitates LC3 processing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1164—1170. PMID 12207896 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02057-0
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
- Shao Y., Gao Z., Feldman T., Jiang X. (2007). Stimulation of ATG12-ATG5 conjugation by ribonucleic acid. Autophagy. 3: 10—16. PMID 16963840 DOI:10.4161/auto.3270
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:588 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O94817 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |