CAPN10 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CAPN10, CANP10, NIDDM1, calpain 10 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605286 MGI: 1344392 HomoloGene: 36323 GeneCards: CAPN10 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cytoskeletal protein binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • SNARE binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • внутрішньоклітинний • гіалоплазма • клітинна мембрана • мітохондрія • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • actin cytoskeleton reorganization • positive regulation of glucose import • cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis • positive regulation of intracellular transport • positive regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • протеоліз • positive regulation of insulin secretion • cellular response to insulin stimulus • type B pancreatic cell apoptotic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_023089 NM_021251 NM_023083 NM_023084 NM_023085
| NM_023086 NM_023087 NM_023088 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 240.59 – 240.62 Mb | Хр. 1: 92.86 – 92.88 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CAPN10 (англ. Calpain 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 672 амінокислот, а молекулярна маса — 74 952[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRAGRGATPA | | RELFRDAAFP | | AADSSLFCDL | | STPLAQFRED | | ITWRRPQEIC |
ATPRLFPDDP | | REGQVKQGLL | | GDCWFLCACA | | ALQKSRHLLD | | QVIPPGQPSW |
ADQEYRGSFT | | CRIWQFGRWV | | EVTTDDRLPC | | LAGRLCFSRC | | QREDVFWLPL |
LEKVYAKVHG | | SYEHLWAGQV | | ADALVDLTGG | | LAERWNLKGV | | AGSGGQQDRP |
GRWEHRTCRQ | | LLHLKDQCLI | | SCCVLSPRAG | | ARELGEFHAF | | IVSDLRELQG |
QAGQCILLLR | | IQNPWGRRCW | | QGLWREGGEG | | WSQVDAAVAS | | ELLSQLQEGE |
FWVEEEEFLR | | EFDELTVGYP | | VTEAGHLQSL | | YTERLLCHTR | | ALPGAWVKGQ |
SAGGCRNNSG | | FPSNPKFWLR | | VSEPSEVYIA | | VLQRSRLHAA | | DWAGRARALV |
GDSHTSWSPA | | SIPGKHYQAV | | GLHLWKVEKR | | RVNLPRVLSM | | PPVAGTACHA |
YDREVHLRCE | | LSPGYYLAVP | | STFLKDAPGE | | FLLRVFSTGR | | VSLSAIRAVA |
KNTTPGAALP | | AGEWGTVQLR | | GSWRVGQTAG | | GSRNFASYPT | | NPCFPFSVPE |
GPGPRCVRIT | | LHQHCRPSDT | | EFHPIGFHIF | | QVPEGGRSQD | | APPLLLQEPL |
LSCVPHRYAQ | | EVSRLCLLPA | | GTYKVVPSTY | | LPDTEGAFTV | | TIATRIDRPS |
IHSQEMLGQF | | LQEVSIMAVM | | KT |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Література
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
- Brown A.E., Yeaman S.J., Walker M. (2007). Targeted suppression of calpain-10 expression impairs insulin-stimulated glucose uptake in cultured primary human skeletal muscle cells. Mol. Genet. Metab. 91: 318—324. PMID 17572128 DOI:10.1016/j.ymgme.2007.05.001
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1477 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9HC96 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |