CCDC88A

Ідентифікатори

Символи

CCDC88A, APE, GIRDIN, GIV, GRDN, HkRP1, KIAA1212, coiled-coil domain containing 88A, PEHO, PEHOL

Зовнішні ІД

OMIM: 609736 MGI: 1925177 HomoloGene: 41180 GeneCards: CCDC88A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • phosphatidylinositol binding • actin binding • microtubule binding • protein kinase B binding • dynein light intermediate chain binding • G-protein gamma-subunit binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • ендоплазматичний ретикулум • lamellipodium • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • клітинна мембрана • cell leading edge • центросома • Центріоль • цитоскелет • ciliary basal body • COPI-coated Golgi to ER transport vesicle
Біологічний процес	• regulation of actin cytoskeleton organization • нейробіологія розвитку • реплікація ДНК • membrane organization • cell migration • lamellipodium assembly • activation of protein kinase B activity • regulation of DNA replication • TOR signaling • regulation of protein phosphorylation • regulation of cell population proliferation • regulation of neuron projection development • cell projection organization • cytoskeleton-dependent intracellular transport • cytoplasmic microtubule organization • positive regulation of cilium assembly • positive regulation of protein localization to cilium
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55704


108686

Ensembl


ENSG00000115355


ENSMUSG00000032740

UniProt


Q3V6T2


Q5SNZ0

RefSeq (мРНК)


NM_001135597 NM_001254943 NM_018084 NM_001365480


NM_176841 NM_001363368 NM_001363369

RefSeq (білок)


NP_001129069 NP_001241872 NP_060554 NP_001352409


NP_789811 NP_001350297 NP_001350298

Локус (UCSC)

Хр. 2: 55.29 – 55.42 Mb

Хр. 11: 29.32 – 29.46 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCDC88A (англ. Coiled-coil domain containing 88A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 871 амінокислот, а молекулярна маса — 216 042^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MENEIFTPLL	EQFMTSPLVT	WVKTFGPLAA	GNGTNLDEYV	ALVDGVFLNQ
VMLQINPKLE	SQRVNKKVNN	DASLRMHNLS	ILVRQIKFYY	QETLQQLIMM
SLPNVLIIGK	NPFSEQGTEE	VKKLLLLLLG	CAVQCQKKEE	FIERIQGLDF
DTKAAVAAHI	QEVTHNQENV	FDLQWMEVTD	MSQEDIEPLL	KNMALHLKRL
IDERDEHSET	IIELSEERDG	LHFLPHASSS	AQSPCGSPGM	KRTESRQHLS
VELADAKAKI	RRLRQELEEK	TEQLLDCKQE	LEQMEIELKR	LQQENMNLLS
DARSARMYRD	ELDALREKAV	RVDKLESEVS	RYKERLHDIE	FYKARVEELK
EDNQVLLETK	TMLEDQLEGT	RARSDKLHEL	EKENLQLKAK	LHDMEMERDM
DRKKIEELME	ENMTLEMAQK	QSMDESLHLG	WELEQISRTS	ELSEAPQKSL
GHEVNELTSS	RLLKLEMENQ	SLTKTVEELR	TTVDSVEGNA	SKILKMEKEN
QRLSKKVEIL	ENEIVQEKQS	LQNCQNLSKD	LMKEKAQLEK	TIETLRENSE
RQIKILEQEN	EHLNQTVSSL	RQRSQISAEA	RVKDIEKENK	ILHESIKETS
SKLSKIEFEK	RQIKKELEHY	KEKGERAEEL	ENELHHLEKE	NELLQKKITN
LKITCEKIEA	LEQENSELER	ENRKLKKTLD	SFKNLTFQLE	SLEKENSQLD
EENLELRRNV	ESLKCASMKM	AQLQLENKEL	ESEKEQLKKG	LELLKASFKK
TERLEVSYQG	LDIENQRLQK	TLENSNKKIQ	QLESELQDLE	MENQTLQKNL
EELKISSKRL	EQLEKENKSL	EQETSQLEKD	KKQLEKENKR	LRQQAEIKDT
TLEENNVKIG	NLEKENKTLS	KEIGIYKESC	VRLKELEKEN	KELVKRATID
IKTLVTLRED	LVSEKLKTQQ	MNNDLEKLTH	ELEKIGLNKE	RLLHDEQSTD
DSRYKLLESK	LESTLKKSLE	IKEEKIAALE	ARLEESTNYN	QQLRQELKTV
KKNYEALKQR	QDEERMVQSS	PPISGEDNKW	ERESQETTRE	LLKVKDRLIE
VERNNATLQA	EKQALKTQLK	QLETQNNNLQ	AQILALQRQT	VSLQEQNTTL
QTQNAKLQVE	NSTLNSQSTS	LMNQNAQLLI	QQSSLENENE	SVIKEREDLK
SLYDSLIKDH	EKLELLHERQ	ASEYESLISK	HGTLKSAHKN	LEVEHRDLED
RYNQLLKQKG	QLEDLEKMLK	VEQEKMLLEN	KNHETVAAEY	KKLCGENDRL
NHTYSQLLKE	TEVLQTDHKN	LKSLLNNSKL	EQTRLEAEFS	KLKEQYQQLD
ITSTKLNNQC	ELLSQLKGNL	EEENRHLLDQ	IQTLMLQNRT	LLEQNMESKD
LFHVEQRQYI	DKLNELRRQK	EKLEEKIMDQ	YKFYDPSPPR	RRGNWITLKM
RKLIKSKKDI	NRERQKSLTL	TPTRSDSSEG	FLQLPHQDSQ	DSSSVGSNSL
EDGQTLGTKK	SSMVALKRLP	FLRNRPKDKD	KMKACYRRSM	SMNDLVQSMV
LAGQWTGSTE	NLEVPDDIST	GKRRKELGAM	AFSTTAINFS	TVNSSAGFRS
KQLVNNKDTT	SFEDISPQGV	SDDSSTGSRV	HASRPASLDS	GRTSTSNSNN
NASLHEVKAG	AVNNQSRPQS	HSSGEFSLLH	DHEAWSSSGS	SPIQYLKRQT
RSSPVLQHKI	SETLESRHHK	IKTGSPGSEV	VTLQQFLEES	NKLTSVQIKS
SSQENLLDEV	MKSLSVSSDF	LGKDKPVSCG	LARSVSGKTP	GDFYDRRTTK
PEFLRPGPRK	TEDTYFISSA	GKPTPGTQGK	IKLVKESSLS	RQSKDSNPYA
TLPRASSVIS	TAEGTTRRTS	IHDFLTKDSR	LPISVDSPPA	AADSNTTAAS
NVDKVQESRN	SKSRSREQQS	S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як біогенез та деградація війок, реплікація ДНК, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Le-Niculescu H., Niesman I., Fischer T., DeVries L., Farquhar M.G. (2005). Identification and characterization of GIV, a novel Galpha i/s-interacting protein found on COPI, endoplasmic reticulum-Golgi transport vesicles. J. Biol. Chem. 280: 22012—22020. PMID 15749703 DOI:10.1074/jbc.M501833200
Enomoto A., Ping J., Takahashi M. (2006). Girdin, a novel actin-binding protein, and its family of proteins possess versatile functions in the Akt and Wnt signaling pathways. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1086: 169—184. PMID 17185515 DOI:10.1196/annals.1377.016

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25523 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2015. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q3V6T2 (англ.) . Архів оригіналу за 9 липня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.