CD2BP2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1GYF, 1L2Z, 1SYX, 4BWS | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CD2BP2, FWP010, LIN1, PPP1R59, Snu40, U5-52K, CD2 (cytoplasmic tail) binding protein 2, CD2 cytoplasmic tail binding protein 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604470 MGI: 1917483 HomoloGene: 4455 GeneCards: CD2BP2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ribonucleoprotein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • U5 snRNP • nuclear speck • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • fibrillar center • цитоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of phosphatase activity • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • spliceosomal tri-snRNP complex assembly • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001285905 NM_001285906 NM_001285907 NM_027353 NM_001357817 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001230575 NP_006101 NP_001230575.1 NP_006101.1 |
| | NP_001272834 NP_001272835 NP_001272836 NP_081629 NP_001344746 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 30.35 – 30.36 Mb | Хр. 7: 126.79 – 126.8 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CD2BP2 (англ. CD2 cytoplasmic tail binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 341 амінокислот, а молекулярна маса — 37 646[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPKRKVTFQG | | VGDEEDEDEI | | IVPKKKLVDP | | VAGSGGPGSR | | FKGKHSLDSD |
EEEDDDDGGS | | SKYDILASED | | VEGQEAATLP | | SEGGVRITPF | | NLQEEMEEGH |
FDADGNYFLN | | RDAQIRDSWL | | DNIDWVKIRE | | RPPGQRQASD | | SEEEDSLGQT |
SMSAQALLEG | | LLELLLPRET | | VAGALRRLGA | | RGGGKGRKGP | | GQPSSPQRLD |
RLSGLADQMV | | ARGNLGVYQE | | TRERLAMRLK | | GLGCQTLGPH | | NPTPPPSLDM |
FAEELAEEEL | | ETPTPTQRGE | | AESRGDGLVD | | VMWEYKWENT | | GDAELYGPFT |
SAQMQTWVSE | | GYFPDGVYCR | | KLDPPGGQFY | | NSKRIDFDLY | | T |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Nishizawa K., Freund C., Li J., Wagner G., Reinherz E.L. (1998). Identification of a proline-binding motif regulating CD2-triggered T lymphocyte activation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 14897—14902. PMID 9843987 DOI:10.1073/pnas.95.25.14897
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
- Heinze M., Kofler M., Freund C. (2007). Investigating the functional role of CD2BP2 in T cells. Int. Immunol. 19: 1313—1318. PMID 17906334 DOI:10.1093/intimm/dxm100
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Freund C., Dotsch V., Nishizawa K., Reinherz E.L., Wagner G. (1999). The GYF domain is a novel structural fold that is involved in lymphoid signaling through proline-rich sequences. Nat. Struct. Biol. 6: 656—660. PMID 10404223 DOI:10.1038/10712
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1656 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O95400 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |