CLASP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLASP1, MAST1, cytoplasmic linker associated protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605852 MGI: 1923957 HomoloGene: 41024 GeneCards: CLASP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • kinetochore binding • dystroglycan binding • microtubule binding • microtubule plus-end binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • центросома • комплекс Ґольджі • kinetochore microtubule • мембрана • cortical microtubule cytoskeleton • focal adhesion • веретено поділу • centrosomal corona • хромосома • microtubule plus-end • центр організації мікротрубочок • cell cortex • spindle microtubule • cytoplasmic microtubule • basal cortex • екзосома • центромера • цитоскелет • мікротрубочка • кінетохор |
---|
Біологічний процес | • establishment of epithelial cell polarity • vesicle targeting • Golgi organization • GO:0043148 mitotic spindle organization • regulation of epithelial to mesenchymal transition • regulation of microtubule cytoskeleton organization • positive regulation of epithelial cell migration • exit from mitosis • поділ клітини • establishment or maintenance of cell polarity • positive regulation of extracellular matrix disassembly • positive regulation of basement membrane assembly involved in embryonic body morphogenesis • negative regulation of microtubule depolymerization • mitotic spindle assembly • microtubule anchoring • G2/M transition of mitotic cell cycle • microtubule bundle formation • negative regulation of microtubule polymerization or depolymerization • positive regulation of microtubule polymerization • regulation of focal adhesion assembly • negative regulation of wound healing, spreading of epidermal cells • клітинний цикл • positive regulation of exocytosis • negative regulation of stress fiber assembly • establishment of spindle orientation • astral microtubule organization • microtubule organizing center organization • establishment of mitotic spindle localization • regulation of gastrulation • microtubule cytoskeleton organization • Нуклеація елементів цитоскелету • sister chromatid cohesion • ciliary basal body-plasma membrane docking • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001142273 NM_001142274 NM_001207051 NM_015282 NM_001378003
| NM_001378004 NM_001378005 NM_001395891 |
| NM_001081276 NM_001293300 NM_001293301 NM_029709 NM_177548
| NM_001359328 NM_001359329 NM_001359330 NM_001359331 NM_001359334 NM_001359335 NM_001359336 NM_001359337 NM_001359338 NM_001359339 NM_001359340 NM_001359341 NM_001359342 NM_001359343 NM_001359345 NM_001359346 NM_001359347 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001135745 NP_001135746 NP_001193980 NP_056097 NP_001364932
| NP_001364933 NP_001364934 |
| NP_001280229 NP_001280230 NP_083985 NP_001346257 NP_001346258
| NP_001346259 NP_001346260 NP_001346263 NP_001346264 NP_001346265 NP_001346266 NP_001346267 NP_001346268 NP_001346269 NP_001346270 NP_001346271 NP_001346272 NP_001346274 NP_001346275 NP_001346276 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 121.34 – 121.65 Mb | Хр. 1: 118.39 – 118.61 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLASP1 (англ. Cytoplasmic linker associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 538 амінокислот, а молекулярна маса — 169 451[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEPRMESCLA | | QVLQKDVGKR | | LQVGQELIDY | | FSDKQKSADL | | EHDQTMLDKL |
VDGLATSWVN | | SSNYKVVLLG | | MDILSALVTR | | LQDRFKAQIG | | TVLPSLIDRL |
GDAKDSVREQ | | DQTLLLKIMD | | QAANPQYVWD | | RMLGGFKHKN | | FRTREGICLC |
LIATLNASGA | | QTLTLSKIVP | | HICNLLGDPN | | SQVRDAAINS | | LVEIYRHVGE |
RVRADLSKKG | | LPQSRLNVIF | | TKFDEVQKSG | | NMIQSANDKN | | FDDEDSVDGN |
RPSSASSTSS | | KAPPSSRRNV | | GMGTTRRLGS | | STLGSKSSAA | | KEGAGAVDEE |
DFIKAFDDVP | | VVQIYSSRDL | | EESINKIREI | | LSDDKHDWEQ | | RVNALKKIRS |
LLLAGAAEYD | | NFFQHLRLLD | | GAFKLSAKDL | | RSQVVREACI | | TLGHLSSVLG |
NKFDHGAEAI | | MPTIFNLIPN | | SAKIMATSGV | | VAVRLIIRHT | | HIPRLIPVIT |
SNCTSKSVAV | | RRRCFEFLDL | | LLQEWQTHSL | | ERHISVLAET | | IKKGIHDADS |
EARIEARKCY | | WGFHSHFSRE | | AEHLYHTLES | | SYQKALQSHL | | KNSDSIVSLP |
QSDRSSSSSQ | | ESLNRPLSAK | | RSPTGSTTSR | | ASTVSTKSVS | | TTGSLQRSRS |
DIDVNAAASA | | KSKVSSSSGT | | TPFSSAAALP | | PGSYASLGRI | | RTRRQSSGSA |
TNVASTPDNR | | GRSRAKVVSQ | | SQRSRSANPA | | GAGSRSSSPG | | KLLGSGYGGL |
TGGSSRGPPV | | TPSSEKRSKI | | PRSQGCSRET | | SPNRIGLARS | | SRIPRPSMSQ |
GCSRDTSRES | | SRDTSPARGF | | PPLDRFGLGQ | | PGRIPGSVNA | | MRVLSTSTDL |
EAAVADALKK | | PVRRRYEPYG | | MYSDDDANSD | | ASSVCSERSY | | GSRNGGIPHY |
LRQTEDVAEV | | LNHCASSNWS | | ERKEGLLGLQ | | NLLKSQRTLS | | RVELKRLCEI |
FTRMFADPHS | | KRVFSMFLET | | LVDFIIIHKD | | DLQDWLFVLL | | TQLLKKMGAD |
LLGSVQAKVQ | | KALDVTRDSF | | PFDQQFNILM | | RFIVDQTQTP | | NLKVKVAILK |
YIESLARQMD | | PTDFVNSSET | | RLAVSRIITW | | TTEPKSSDVR | | KAAQIVLISL |
FELNTPEFTM | | LLGALPKTFQ | | DGATKLLHNH | | LKNSSNTSVG | | SPSNTIGRTP |
SRHTSSRTSP | | LTSPTNCSHG | | GLSPSRLWGW | | SADGLAKHPP | | PFSQPNSIPT |
APSHKALRRS | | YSPSMLDYDT | | ENLNSEEIYS | | SLRGVTEAIE | | KFSFRSQEDL |
NEPIKRDGKK | | ECDIVSRDGG | | AASPATEGRG | | GSEVEGGRTA | | LDNKTSLLNT |
QPPRAFPGPR | | ARDYNPYPYS | | DAINTYDKTA | | LKEAVFDDDM | | EQLRDVPIDH |
SDLVADLLKE | | LSNHNERVEE | | RKGALLELLK | | ITREDSLGVW | | EEHFKTILLL |
LLETLGDKDH | | SIRALALRVL | | REILRNQPAR | | FKNYAELTIM | | KTLEAHKDSH |
KEVVRAAEEA | | ASTLASSIHP | | EQCIKVLCPI | | IQTADYPINL | | AAIKMQTKVV |
ERIAKESLLQ | | LLVDIIPGLL | | QGYDNTESSV | | RKASVFCLVA | | IYSVIGEDLK |
PHLAQLTGSK | | MKLLNLYIKR | | AQTTNSNSSS | | SSDVSTHS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, хромосомах, центромерах, апараті гольджі, кінетохорі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17088 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q7Z460 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |