CLDN1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLDN1, CLD1, ILVASC, SEMP1, claudin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603718 MGI: 1276109 HomoloGene: 9620 GeneCards: CLDN1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity • identical protein binding • virus receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • apical plasma membrane • lateral plasma membrane • bicellular tight junction • цитоплазма • basolateral plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • viral entry into host cell • cell-cell junction organization • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • GO:0022415 viral process • protein homooligomerization • protein heterooligomerization • establishment of skin barrier • bicellular tight junction assembly • GO:0010260 старіння людини • establishment of blood-nerve barrier • response to toxic substance • response to lipopolysaccharide • hyperosmotic salinity response • response to ethanol • xenobiotic transport across blood-nerve barrier • response to interleukin-18 • cellular response to lead ion • cellular response to interferon-gamma • cellular response to tumor necrosis factor • response to dexamethasone • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • establishment of endothelial intestinal barrier • liver regeneration • positive regulation of bicellular tight junction assembly • cellular response to butyrate |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 190.31 – 190.32 Mb | Хр. 16: 26.18 – 26.19 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLDN1 (англ. Claudin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 22 744[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MANAGLQLLG | | FILAFLGWIG | | AIVSTALPQW | | RIYSYAGDNI | | VTAQAMYEGL |
WMSCVSQSTG | | QIQCKVFDSL | | LNLSSTLQAT | | RALMVVGILL | | GVIAIFVATV |
GMKCMKCLED | | DEVQKMRMAV | | IGGAIFLLAG | | LAILVATAWY | | GNRIVQEFYD |
PMTPVNARYE | | FGQALFTGWA | | AASLCLLGGA | | LLCCSCPRKT | | TSYPTPRPYP |
KPAPSSGKDY | | V |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.
Література
- Kraemer F., White K., Kubbies M., Swisshelm K.L., Weber B.H.F. (2000). Genomic organization of claudin-1 and its assessment in hereditary and sporadic breast cancer. Hum. Genet. 107: 249—256. PMID 11071387 DOI:10.1007/s004390000375
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Che P., Tang H., Li Q. (2013). The interaction between claudin-1 and dengue viral prM/M protein for its entry. Virology. 446: 303—313. PMID 24074594 DOI:10.1016/j.virol.2013.08.009
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2032 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O95832 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |