CLDN18

Ідентифікатори

Символи

CLDN18, SFTA5, SFTPJ, claudin 18

Зовнішні ІД

OMIM: 609210 MGI: 1929209 HomoloGene: 9489 GeneCards: CLDN18

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • мембрана • bicellular tight junction
Біологічний процес	• negative regulation of protein localization to nucleus • TNFSF11-mediated signaling pathway • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • digestive tract development • negative regulation of osteoclast development • negative regulation of bone resorption • response to ethanol
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51208


56492

Ensembl


ENSG00000066405


ENSMUSG00000032473

UniProt


P56856


P56857

RefSeq (мРНК)


NM_016369 NM_001002026


NM_001194921 NM_001194922 NM_001194923 NM_019815

RefSeq (білок)


NP_001002026 NP_057453


NP_001181850 NP_001181851 NP_001181852 NP_062789

Локус (UCSC)

Хр. 3: 138 – 138.03 Mb

Хр. 9: 99.57 – 99.6 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLDN18 (англ. Claudin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 27 856^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTTTCQVVA	FLLSILGLAG	CIAATGMDMW	STQDLYDNPV	TSVFQYEGLW
RSCVRQSSGF	TECRPYFTIL	GLPAMLQAVR	ALMIVGIVLG	AIGLLVSIFA
LKCIRIGSME	DSAKANMTLT	SGIMFIVSGL	CAIAGVSVFA	NMLVTNFWMS
TANMYTGMGG	MVQTVQTRYT	FGAALFVGWV	AGGLTLIGGV	MMCIACRGLA
PEETNYKAVS	YHASGHSVAY	KPGGFKASTG	FGSNTKNKKI	YDGGARTEDE
VQSYPSKHDY	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2039 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P56856 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.