CLEC3B : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CLEC3B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1HTN, 1RJH, 1TN3, 3L9J

Ідентифікатори

Символи

CLEC3B, TN, TNA, C-type lectin domain family 3 member B

Зовнішні ІД

OMIM: 187520 MGI: 104540 HomoloGene: 31145 GeneCards: CLEC3B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • heparin binding • kringle domain binding • carbohydrate binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • екзосома • granular component • platelet dense granule lumen • міжклітинний простір • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• cellular response to organic substance • bone mineralization • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • positive regulation of plasminogen activation • осифікація • platelet degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7123


21922

Ensembl


ENSG00000163815


ENSMUSG00000025784

UniProt


P05452


P43025 Q8CFZ6

RefSeq (мРНК)


NM_001308394 NM_003278


NM_011606

RefSeq (білок)


NP_001295323 NP_003269


NP_035736

Локус (UCSC)

Хр. 3: 45 – 45.04 Mb

Хр. 9: 122.98 – 122.99 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLEC3B (англ. C-type lectin domain family 3 member B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 202 амінокислот, а молекулярна маса — 22 537^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELWGAYLLL	CLFSLLTQVT	TEPPTQKPKK	IVNAKKDVVN	TKMFEELKSR
LDTLAQEVAL	LKEQQALQTV	CLKGTKVHMK	CFLAFTQTKT	FHEASEDCIS
RGGTLGTPQT	GSENDALYEY	LRQSVGNEAE	IWLGLNDMAA	EGTWVDMTGA
RIAYKNWETE	ITAQPDGGKT	ENCAVLSGAA	NGKWFDKRCR	DQLPYICQFG
IV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Секретований назовні.

Література

Berglund L., Petersen T.E. (1992). The gene structure of tetranectin, a plasminogen binding protein. FEBS Lett. 309: 15—19. PMID 1511740 DOI:10.1016/0014-5793(92)80729-Z
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fuhlendorff J., Clemmensen I., Magnusson S. (1987). Primary structure of tetranectin, a plasminogen kringle 4 binding plasma protein: homology with asialoglycoprotein receptors and cartilage proteoglycan core protein. Biochemistry. 26: 6757—6764. PMID 3427041 DOI:10.1021/bi00395a027
Wewer U.M., Albrechtsen R. (1992). Tetranectin, a plasminogen kringle 4-binding protein. Cloning and gene expression pattern in human colon cancer. Lab. Invest. 67: 253—262. PMID 1354271

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11891 (англ.) . Архів оригіналу за 17 червня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P05452 (англ.) . Архів оригіналу за 14 грудня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.