CPSF6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3P5T, 3P6Y, 3Q2S, 3Q2T, 4B4N, 4U0A, 4U0B, 4WYM | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CPSF6, CFIM, CFIM68, HPBRII-4, HPBRII-7, cleavage and polyadenylation specific factor 6, CFIM72 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604979 MGI: 1913948 HomoloGene: 134126 GeneCards: CPSF6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • ribosomal large subunit binding • exon-exon junction complex binding |
---|
Клітинна компонента | • paraspeckles • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck • mRNA cleavage factor complex • perichromatin fibrils • цитоплазма • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • interchromatin granule • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • mRNA polyadenylation • mRNA processing • protein tetramerization • positive regulation of RNA export from nucleus • protein heterotetramerization • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • mRNA alternative polyadenylation • messenger ribonucleoprotein complex assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 69.24 – 69.27 Mb | Хр. 10: 117.18 – 117.22 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CPSF6 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 551 амінокислот, а молекулярна маса — 59 210[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADGVDHIDI | | YADVGEEFNQ | | EAEYGGHDQI | | DLYDDVISPS | | ANNGDAPEDR |
DYMDTLPPTV | | GDDVGKGAAP | | NVVYTYTGKR | | IALYIGNLTW | | WTTDEDLTEA |
VHSLGVNDIL | | EIKFFENRAN | | GQSKGFALVG | | VGSEASSKKL | | MDLLPKRELH |
GQNPVVTPCN | | KQFLSQFEMQ | | SRKTTQSGQM | | SGEGKAGPPG | | GSSRAAFPQG |
GRGRGRFPGA | | VPGGDRFPGP | | AGPGGPPPPF | | PAGQTPPRPP | | LGPPGPPGPP |
GPPPPGQVLP | | PPLAGPPNRG | | DRPPPPVLFP | | GQPFGQPPLG | | PLPPGPPPPV |
PGYGPPPGPP | | PPQQGPPPPP | | GPFPPRPPGP | | LGPPLTLAPP | | PHLPGPPPGA |
PPPAPHVNPA | | FFPPPTNSGM | | PTSDSRGPPP | | TDPYGRPPPY | | DRGDYGPPGR |
EMDTARTPLS | | EAEFEEIMNR | | NRAISSSAIS | | RAVSDASAGD | | YGSAIETLVT |
AISLIKQSKV | | SADDRCKVLI | | SSLQDCLHGI | | ESKSYGSGSR | | RERSRERDHS |
RSREKSRRHK | | SRSRDRHDDY | | YRERSRERER | | HRDRDRDRDR | | ERDREREYRH |
R |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Rueegsegger U., Blank D., Keller W. (1998). Human pre-mRNA cleavage factor Im is related to spliceosomal SR proteins and can be reconstituted in vitro from recombinant subunits. Mol. Cell. 1: 243—253. PMID 9659921 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80025-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rueegsegger U., Beyer K., Keller W. (1996). Purification and characterization of human cleavage factor Im involved in the 3' end processing of messenger RNA precursors. J. Biol. Chem. 271: 6107—6113. PMID 8626397 DOI:10.1074/jbc.271.11.6107
- Brown K.M., Gilmartin G.M. (2003). A mechanism for the regulation of pre-mRNA 3' processing by human cleavage factor Im. Mol. Cell. 12: 1467—1476. PMID 14690600 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00453-2
- Dettwiler S., Aringhieri C., Cardinale S., Keller W., Barabino S.M. (2004). Distinct sequence motifs within the 68-kDa subunit of cleavage factor Im mediate RNA binding, protein-protein interactions, and subcellular localization. J. Biol. Chem. 279: 35788—35797. PMID 15169763 DOI:10.1074/jbc.M403927200
- Awasthi S., Alwine J.C. (2003). Association of polyadenylation cleavage factor I with U1 snRNP. RNA. 9: 1400—1409. PMID 14561889 DOI:10.1261/rna.5104603
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13871 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q16630 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |