DACH1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1L8R

Ідентифікатори

Символи

DACH1, DACH, dachshund family transcription factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603803 MGI: 1277991 HomoloGene: 7288 GeneCards: DACH1

Пов'язані генетичні захворювання

бічний аміотрофічний склероз, захворювання нирок^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of transcription by competitive promoter binding • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • respiratory gaseous exchange by respiratory system • transcription, DNA-templated • development of primary female sexual characteristics • negative regulation of cell migration • regulation of nuclear cell cycle DNA replication • negative regulation of cell proliferation involved in contact inhibition • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of fibroblast proliferation • negative regulation of DNA biosynthetic process • suckling behavior • multicellular organism development • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1602


13134

Ensembl


ENSG00000276644


ENSMUSG00000055639

UniProt


Q9UI36


Q9QYB2

RefSeq (мРНК)


NM_004392 NM_080759 NM_080760 NM_001366712


NM_001038610 NM_007826

RefSeq (білок)


NP_004383 NP_542937 NP_542938 NP_001353641


NP_001033699 NP_031852

Локус (UCSC)

Хр. 13: 71.44 – 71.87 Mb

Хр. 14: 98.02 – 98.41 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DACH1 (англ. Dachshund family transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 760 амінокислот, а молекулярна маса — 78 676^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVPAALIPP	TQLVPPQPPI	STSASSSGTT	TSTSSATSSP	APSIGPPASS
GPTLFRPEPI	ASAAAAAATV	TSTGGGGGGG	GGGSGGGGGS	SGNGGGGGGG
GGGSNCNPNL	AAASNGSGGG	GGGISAGGGV	ASSTPINAST	GSSSSSSSSS
SSSSSSSSSS	SSSSSCGPLP	GKPVYSTPSP	VENTPQNNEC	KMVDLRGAKV
ASFTVEGCEL	ICLPQAFDLF	LKHLVGGLHT	VYTKLKRLEI	TPVVCNVEQV
RILRGLGAIQ	PGVNRCKLIS	RKDFETLYND	CTNASSRPGR	PPKRTQSVTS
PENSHIMPHS	VPGLMSPGII	PPTGLTAAAA	AAAAATNAAI	AEAMKVKKIK
LEAMSNYHAS	NNQHGADSEN	GDMNSSVGSS	DGSWDKETLP	SSPSQGPQAS
ITHPRMPGAR	SLPLSHPLNH	LQQSHLLPNG	LELPFMMMPH	PLIPVSLPPA
SVTMAMSQMN	HLSTIANMAA	AAQVQSPPSR	VETSVIKERV	PDSPSPAPSL
EEGRRPGSHP	SSHRSSSVSS	SPARTESSSD	RIPVHQNGLS	MNQMLMGLSP
NVLPGPKEGD	LAGHDMGHES	KRMHIEKDET	PLSTPTARDS	LDKLSLTGHG
QPLPPGFPSP	FLFPDGLSSI	ETLLTNIQGL	LKVAIDNARA	QEKQVQLEKT
ELKMDFLRER	ELRETLEKQL	AMEQKNRAIV	QKRLKKEKKA	KRKLQEALEF
ETKRREQAEQ	TLKQAASTDS	LRVLNDSLTP	EIEADRSGGR	TDAERTIQDG
RLYLKTTVMY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Hammond K.L., Hanson I.M., Brown A.G., Lettice L.A., Hill R.E. (1998). Mammalian and Drosophila dachshund genes are related to the Ski proto-oncogene and are expressed in eye and limb. Mech. Dev. 74: 121—131. PMID 9651501 DOI:10.1016/S0925-4773(98)00071-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DACH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2663 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UI36 (англ.) . Архів оригіналу за 28 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.