DCP2

Ідентифікатори

Символи

DCP2, NUDT20, decapping mRNA 2

Зовнішні ІД

OMIM: 609844 MGI: 1917890 HomoloGene: 13968 GeneCards: DCP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• m7G(5')pppN diphosphatase activity • manganese ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters • RNA binding • hydrolase activity • 5'-3' exoribonuclease activity • telomerase RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • RISC • гіалоплазма • P-body • нуклеоплазма • міжклітинні контакти • клітинне ядро • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Біологічний процес	• mRNA catabolic process • regulation of mRNA stability • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • histone mRNA catabolic process • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • negative regulation of telomere maintenance via telomerase • regulation of telomerase RNA localization to Cajal body
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


167227


70640

Ensembl


ENSG00000172795


ENSMUSG00000024472

UniProt


Q8IU60


Q9CYC6

RefSeq (мРНК)


NM_001242377 NM_152624


NM_027490

RefSeq (білок)


NP_001229306 NP_689837


NP_081766

Локус (UCSC)

Хр. 5: 112.98 – 113.02 Mb

Хр. 18: 44.51 – 44.56 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DCP2 (англ. Decapping mRNA 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 420 амінокислот, а молекулярна маса — 48 457^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
METKRVEIPG	SVLDDFCSRF	ILHIPSEERD	NAIRVCFQIE	LAHWFYLDFY
MQNTPGLPQC	GIRDFAKAVF	SHCPFLLPQG	EDVEKVLDEW	KEYKMGVPTY
GAIILDETLE	NVLLVQGYLA	KSGWGFPKGK	VNKEEAPHDC	AAREVFEETG
FDIKDYICKD	DYIELRINDQ	LARLYIIPGI	PKDTKFNPKT	RREIRNIEWF
SIEKLPCHRN	DMTPKSKLGL	APNKFFMAIP	FIRPLRDWLS	RRFGDSSDSD
NGFSSTGSTP	AKPTVEKLSR	TKFRHSQQLF	PDGSPGDQWV	KHRQPLQQKP
YNNHSEMSDL	LKGKNQSMRG	NGRKQYQDSP	NQKKRTNGLQ	PAKQQNSLMK
CEKKLHPRKL	QDNFETDAVY	DLPSSSEDQL	LEHAEGQPVA	CNGHCKFPFS
SRAFLSFKFD	HNAIMKILDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Lykke-Andersen J. (2002). Identification of a human decapping complex associated with hUpf proteins in nonsense-mediated decay. Mol. Cell. Biol. 22: 8114—8121. PMID 12417715 DOI:10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002
Wang Z., Jiao X., Carr-Schmid A., Kiledjian M. (2002). The hDcp2 protein is a mammalian mRNA decapping enzyme. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12663—12668. PMID 12218187 DOI:10.1073/pnas.192445599
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lejeune F., Li X., Maquat L.E. (2003). Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities. Mol. Cell. 12: 675—687. PMID 14527413 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00349-6
Piccirillo C., Khanna R., Kiledjian M. (2003). Functional characterization of the mammalian mRNA decapping enzyme hDcp2. RNA. 9: 1138—1147. PMID 12923261 DOI:10.1261/rna.5690503
Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation. Genome Res. 14: 1315—1323. PMID 15231747 DOI:10.1101/gr.2122004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24452 (англ.) . Архів оригіналу за 21 травня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IU60 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.