DENND4A

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2PSN, 3B97

Ідентифікатори

Символи

DENND4A, IRLB, MYCPBP, DENN domain containing 4A

Зовнішні ІД

OMIM: 600382 MGI: 2142979 HomoloGene: 55933 GeneCards: DENND4A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10260


102442

Ensembl


ENSG00000174485


ENSMUSG00000053641

UniProt


Q7Z401


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001144823 NM_005848 NM_001320835 NM_001376919 NM_001376920


NM_001162917 NM_176935

RefSeq (білок)


NP_001138295 NP_001307764 NP_005839 NP_001363848 NP_001363849


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 15: 65.66 – 65.79 Mb

Хр. 9: 64.72 – 64.83 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DENND4A (англ. DENN domain containing 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 863 амінокислот, а молекулярна маса — 209 244^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIEDKGPRVA	DYFVVAGLTD	VSKPLEEEIH	FNDACHKVAK	PKEPITDVSV
IIKSLGEEVP	QDYICIDVTP	TGLSADLNNG	SLVGPQIYLC	YRRGRDKPPL
TDLGVLYDWK	ERLKQGCEII	QSTPYGRPAN	ISGSTSSQRI	YITYRRASEN
MTQNTLAVTD	ICIIIPSKGE	SPPHTFCKVD	KNLNNSMWGS	AVYLCYKKSV
AKTNTVSYKA	GLICRYPQED	YESFSLPESV	PLFCLPMGAT	IECWPSNSKY
PLPVFSTFVL	TGASAEKVYG	AAIQFYEPYS	EENLTEKQRL	LLGLTSADGK
SDSSKTIHTN	KCICLLSHWP	FFDAFRKFLT	FLYRYSISGP	HVLPIEKHIS
HFMHKVPFPS	PQRPRILVQL	SPHDNLILSQ	PVSSPLPLSG	GKFSTLLQNL
GPENAVTLLV	FAVTEHKILI	HSLRPSVLTS	VTEALVSMIF	PFHWPCPYVP
LCPLALADVL	SAPCPFIVGI	DSRYFDLYDP	PPDVSCVDVD	TNTISQIGDK
KNVAWKILPK	KPCKNLMNTL	NNLHQQLAKL	QQRPRDDGLM	DLAINDYDFN
SGKRLHMIDL	EIQEAFLFFM	ASILKGYRSY	LRPITQAPSE	TATDAASLFA
LQAFLRSRDR	SHQKFYNMMT	KTQMFIRFIE	ECSFVSDKDA	SLAFFDDCVD
KVDMDKSGEV	RLIELDESFK	SEHTVFVTPP	EIPHLPNGEE	PPLQYSYNGF
PVLRNNLFER	PEGFLQAKKN	KLPSKSSSPN	SPLPMFRRTK	QEIKSAHKIA
KRYSSIPQMW	SRCLLRHCYG	LWFICLPAYV	KVCHSKVRAL	KTAYDVLKKM
QSKKMDPPDE	VCYRILMQLC	GQYDQPVLAV	RVLFEMQKAG	IDPNAITYGY
YNKAVLESTW	PSRSRSGYFL	WTKVRNVVLG	VTQFKRALKK	HAHLSQTTLS
GGQSDLGYNS	LSKDEVRRGD	TSTEDIQEEK	DKKGSDCSSL	SESESTKGSA
DCLPKLSYQN	SSSIVRLTGT	SNNSAGKISG	ESMESTPELL	LISSLEDTNE
TRNIQSRCFR	KRHKSDNETN	LQQQVVWGNR	NRNLSGGVLM	GFMLNRINQE
ATPGDIVEKL	GADAKILSNV	ISKSTRPNTL	DIGKPPLRSK	RDSLEKESSD
DDTPFDGSNY	LADKVDSPVI	FDLEDLDSET	DVSKAGCVAT	QNPKRIQRMN
SSFSVKPFEK	TDVATGFDPL	SLLVAETEQQ	QKEEEEEDED	DSKSISTPSA
RRDLAEEIVM	YMNNMSSPLT	SRTPSIDLQR	ACDDKLNKKS	PPLVKACRRS
SLPPNSPKPV	RLTKSKSYTK	SEEKPRDRLW	SSPAFSPTCP	FREESQDTLT
HSSPSFNLDT	LLVPKLDVLR	NSMFTAGKGV	AEKASKWYSR	FTMYTTSSKD
QSSDRTSLSS	VGAQDSESTS	LTDEDVCHEL	EGPISSQETS	ATSGTKRIDL
SRISLESSAS	LEGSLSKFAL	PGKSEVTSSF	NASNTNIFQN	YAMEVLISSC
SRCRTCDCLV	HDEEIMAGWT	ADDSNLNTTC	PFCGNIFLPF	LNIEIRDLRR
PGRYFLKSSP	STENMHFPSS	ISSQTRQSCI	STSASGLDTS	ALSVQGNFDL
NSKSKLQENF	CTRSIQIPAN	RSKTAMSKCP	IFPMARSIST	SGPLDKEDTG
RQKLISTGSL	PATLQGATDS	LGLEWHLPSP	DPVTVPYLSP	LVVWKELESL
LENEGDHAIT	VADFVDHHPI	VFWNLVWYFR	RLDLPSNLPG	LILSSEHCNK
YSKIPRHCMS	EDSKYVLIQM	LWDNMKLHQD	PGQPLYILWN	AHTQKYPMVH
LLQKSDNSFN	QELLKSMVKS	IKMNDVYGPM	SQILETLNKC	PHFKRQRSLY
REILFLSLVA	LGRENIDIDA	FDKEYKMAYD	RLTPSQVKST	HNCDRPPSTG
VMECRKTFGE	PYL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yoshimura S., Gerondopoulos A., Linford A., Rigden D.J., Barr F.A. (2010). Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors. J. Cell Biol. 191: 367—381. PMID 20937701 DOI:10.1083/jcb.201008051

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24321 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q7Z401 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.