GCA |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1F4O, 1F4Q, 1K94, 1K95 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | GCA, GCL, grancalcin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607030 MGI: 1918521 HomoloGene: 22702 GeneCards: GCA |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity • protein heterodimerization activity • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • extracellular region • гіалоплазма • azurophil granule lumen • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • membrane fusion • протеоліз • neutrophil degranulation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_012198 NM_001330265 NM_001330266 NM_001330267 NM_001330268
| NM_001330270 NM_001330271 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001317194 NP_001317195 NP_001317196 NP_001317197 NP_001317199
| NP_001317200 NP_036330 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 162.32 – 162.37 Mb | Хр. 2: 62.49 – 62.52 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GCA (англ. Grancalcin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 24 010[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAYPGYGGGF | | GNFSIQVPGM | | QMGQPVPETG | | PAILLDGYSG | | PAYSDTYSSA |
GDSVYTYFSA | | VAGQDGEVDA | | EELQRCLTQS | | GINGTYSPFS | | LETCRIMIAM |
LDRDHTGKMG | | FNAFKELWAA | | LNAWKENFMT | | VDQDGSGTVE | | HHELRQAIGL |
MGYRLSPQTL | | TTIVKRYSKN | | GRIFFDDYVA | | CCVKLRALTD | | FFRKRDHLQQ |
GSANFIYDDF | | LQGTMAI |
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Teahan C.G., Totty N.F., Segal A.W. (1992). Isolation and characterization of grancalcin, a novel 28 kDa EF-hand calcium-binding protein from human neutrophils. Biochem. J. 286: 549—554. PMID 1530588 DOI:10.1042/bj2860549
- Lollike K., Johnsen A.H., Durussel I., Borregaard N., Cox J.A. (2001). Biochemical characterization of the penta-EF-hand protein grancalcin and identification of L-plastin as a binding partner. J. Biol. Chem. 276: 17762—17769. PMID 11279160 DOI:10.1074/jbc.M100965200
- Hansen C., Tarabykina S., la Cour J.M., Lollike K., Berchtold M.W. (2003). The PEF family proteins sorcin and grancalcin interact in vivo and in vitro. FEBS Lett. 545: 151—154. PMID 12804766 DOI:10.1016/S0014-5793(03)00518-0
- Jia J., Han Q., Borregaard N., Lollike K., Cygler M. (2000). Crystal structure of human grancalcin, a member of the penta-EF-hand protein family. J. Mol. Biol. 300: 1271—1281. PMID 10903868 DOI:10.1006/jmbi.2000.3925
- Jia J., Borregaard N., Lollike K., Cygler M. (2001). Structure of Ca(2+)-loaded human grancalcin. Acta Crystallogr. D. 57: 1843—1849. PMID 11717497 DOI:10.1107/S0907444901016511
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15990 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P28676 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |