GCFC2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | GCFC2, C2orf3, DNABF, GCF, TCF9, GC-rich sequence DNA-binding factor 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 189901 MGI: 2141656 HomoloGene: 2411 GeneCards: GCFC2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • клітинне ядро • U2-type post-mRNA release spliceosomal complex • нуклеоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • spliceosomal complex assembly • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001201334 NM_001201335 NM_003203 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001188263 NP_001188264 NP_003194 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 75.65 – 75.71 Mb | Хр. 6: 81.92 – 81.96 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GCFC2 (англ. GC-rich sequence DNA-binding factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 89 385[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAHRPKRTFR | | QRAADSSDSD | | GAEESPAEPG | | APRELPVPGS | | AEEEPPSGGG |
RAQVAGLPHR | | VRGPRGRGRV | | WASSRRATKA | | APRADEGSES | | RTLDVSTDEE |
DKIHHSSESK | | DDQGLSSDSS | | SSLGEKELSS | | TVKIPDAAFI | | QAARRKRELA |
RAQDDYISLD | | VQHTSSISGM | | KRESEDDPES | | EPDDHEKRIP | | FTLRPQTLRQ |
RMAEESISRN | | EETSEESQED | | EKQDTWEQQQ | | MRKAVKIIEE | | RDIDLSCGNG |
SSKVKKFDTS | | ISFPPVNLEI | | IKKQLNTRLT | | LLQETHRSHL | | REYEKYVQDV |
KSSKSTIQNL | | ESSSNQALNC | | KFYKSMKIYV | | ENLIDCLNEK | | IINIQEIESS |
MHALLLKQAM | | TFMKRRQDEL | | KHESTYLQQL | | SRKDETSTSG | | NFSVDEKTQW |
ILEEIESRRT | | KRRQARVLSG | | NCNHQEGTSS | | DDELPSAEMI | | DFQKSQGDIL |
QKQKKVFEEV | | QDDFCNIQNI | | LLKFQQWREK | | FPDSYYEAFI | | SLCIPKLLNP |
LIRVQLIDWN | | PLKLESTGLK | | EMPWFKSVEE | | FMDSSVEDSK | | KESSSDKKVL |
SAIINKTIIP | | RLTDFVEFLW | | DPLSTSQTTS | | LITHCRVILE | | EHSTCENEVS |
KSRQDLLKSI | | VSRMKKAVED | | DVFIPLYPKS | | AVENKTSPHS | | KFQERQFWSG |
LKLFRNILLW | | NGLLTDDTLQ | | ELGLGKLLNR | | YLIIALLNAT | | PGPDVVKKCN |
QVAACLPEKW | | FENSAMRTSI | | PQLENFIQFL | | LQSAHKLSRS | | EFRDEVEEII |
LILVKIKALN | | QAESFIGEHH | | LDHLKSLIKE | | D |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Kageyama R., Pastan I. (1989). Molecular cloning and characterization of a human DNA binding factor that represses transcription. Cell. 59: 815—825. PMID 2556218 DOI:10.1016/0092-8674(89)90605-3
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yoshimoto R., Okawa K., Yoshida M., Ohno M., Kataoka N. (2014). Identification of a novel component C2ORF3 in the lariat-intron complex: lack of C2ORF3 interferes with pre-mRNA splicing via intron turnover pathway. Genes Cells. 19: 78—87. PMID 24304693 DOI:10.1111/gtc.12114
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1317 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P16383 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |