HERC3

Ідентифікатори

Символи

HERC3, HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3

Зовнішні ІД

OMIM: 605200 MGI: 1921248 HomoloGene: 57095 GeneCards: HERC3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
Клітинна компонента	• GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • цитоплазма
Біологічний процес	• Убіквітин-залежний протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8916


73998

Ensembl


ENSG00000138641


ENSMUSG00000029804

UniProt


Q15034


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001271602 NM_014606 NM_001318505 NM_001375477 NM_001375478
NM_001375479 NM_001375480 NM_001375481 NM_001375482 NM_001375483


NM_028705 NM_001361966 NM_001361967

RefSeq (білок)

NP_001258531 NP_001305434 NP_055421 NP_001362406 NP_001362407
NP_001362408 NP_001362409 NP_001362410 NP_001362411 NP_001362412


н/д

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 6: 58.81 – 58.9 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HERC3 (англ. HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 050 амінокислот, а молекулярна маса — 117 188^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLCWGYWSLG	QPGISTNLQG	IVAEPQVCGF	ISDRSVKEVA	CGGNHSVFLL
EDGEVYTCGL	NTKGQLGHER	EGNKPEQIGA	LADQHIIHVA	CGESHSLALS
DRGQLFSWGA	GSDGQLGLMT	TEDSVAVPRL	IQKLNQQTIL	QVSCGNWHCL
ALAADGQFFT	WGKNSHGQLG	LGKEFPSQAS	PQRVRSLEGI	PLAQVAAGGA
HSFALSLSGA	VFGWGMNNAG	QLGLSDEKDR	ESPCHVKLLR	TQKVVYISCG
EEHTAVLTKS	GGVFTFGAGS	CGQLGHDSMN	DEVNPRRVLE	LMGSEVTQIA
CGRQHTLAFV	PSSGLIYAFG	CGARGQLGTG	HTCNVKCPSP	VKGYWAAHSG
QLSARADRFK	YHIVKQIFSG	GDQTFVLCSK	YENYSPAVDF	RTMNQAHYTS
LINDETIAVW	RQKLSEHNNA	NTINGVVQIL	SSAACWNGSF	LEKKIDEHFK
TSPKIPGIDL	NSTRVLFEKL	MNSQHSMILE	QILNSFESCL	IPQLSSSPPD
VEAMRIYLIL	PEFPLLQDSK	YYITLTIPLA	MAILRLDTNP	SKVLDNWWSQ
VCPKYFMKLV	NLYKGAVLYL	LRGRKTFLIP	VLFNNYITAA	LKLLEKLYKV
NLKVKHVEYD	TFYIPEISNL	VDIQEDYLMW	FLHQAGMKAR	PSIIQDTVTL
CSYPFIFDAQ	AKTKMLQTDA	ELQMQVAVNG	ANLQNVFMLL	TLEPLLARSP
FLVLHVRRNN	LVGDALRELS	IHSDIDLKKP	LKVIFDGEEA	VDAGGVTKEF
FLLLLKELLN	PIYGMFTYYQ	DSNLLWFSDT	CFVEHNWFHL	IGITCGLAIY
NSTVVDLHFP	LALYKKLLNV	KPGLEDLKEL	SPTEGRSLQE	LLDYPGEDVE
ETFCLNFTIC	RESYGVIEQK	KLIPGGDNVT	VCKDNRQEFV	DAYVNYVFQI
SVHEWYTAFS	SGFLKVCGGK	VLELFQPSEL	RAMMVGNSNY	NWEELEETAI
YKGDYSATHP	TVKLFWETFH	EFPLEKKKKF	LLFLTGSDRI	PIYGMASLQI
VIQSTASGEE	YLPVAHTCYN	LLDLPKYSSK	EILSARLTQA	LDNYEGFSLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cruz C., Ventura F., Bartrons R., Rosa J.L. (2001). HERC3 binding to and regulation by ubiquitin. FEBS Lett. 488: 74—80. PMID 11163799 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02371-1

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4876 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15034 (англ.) . Архів оригіналу за 14 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.