HLA-DOB

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4I0P

Ідентифікатори

Символи

HLA-DOB, DOB, major histocompatibility complex, class II, DO beta, HLA_DOB

Зовнішні ІД

OMIM: 600629 MGI: 95925 HomoloGene: 1602 GeneCards: HLA-DOB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• MHC class II receptor activity • MHC class II protein complex binding
Клітинна компонента	• lysosomal membrane • endosome membrane • лізосома • мембрана • ендосома • integral component of membrane • внутрішньоклітинний • MHC class II protein complex
Біологічний процес	• negative regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation • процес імунної системи • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • адаптивна імунна відповідь
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3112


15002

Ensembl

ENSG00000243496 ENSG00000241910 ENSG00000243612 ENSG00000239457 ENSG00000241386
ENSG00000241106


ENSMUSG00000041538

UniProt


P13765


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_002120


NM_010389

RefSeq (білок)


NP_002111


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 6: 32.81 – 32.82 Mb

Хр. 17: 34.46 – 34.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HLA-DOB (англ. Major histocompatibility complex, class II, DO beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 822^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSGWVPWVV	ALLVNLTRLD	SSMTQGTDSP	EDFVIQAKAD	CYFTNGTEKV
QFVVRFIFNL	EEYVRFDSDV	GMFVALTKLG	QPDAEQWNSR	LDLLERSRQA
VDGVCRHNYR	LGAPFTVGRK	VQPEVTVYPE	RTPLLHQHNL	LHCSVTGFYP
GDIKIKWFLN	GQEERAGVMS	TGPIRNGDWT	FQTVVMLEMT	PELGHVYTCL
VDHSSLLSPV	SVEWRAQSEY	SWRKMLSGIA	AFLLGLIFLL	VGIVIQLRAQ
KGYVRTQMSG	NEVSRAVLLP	QSC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

Jonsson A.-K., Rask L. (1989). Human class II DNA and DOB genes display low sequence variability. Immunogenetics. 29: 411—413. PMID 2499532 DOI:10.1007/BF00375872
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Alfonso C., Karlsson L. (2000). Nonclassical MHC class II molecules. Annu. Rev. Immunol. 18: 113—142. PMID 10837054 DOI:10.1146/annurev.immunol.18.1.113
Tonnelle C., Demars R., Long E.O. (1985). DO beta: a new beta chain gene in HLA-D with a distinct regulation of expression. EMBO J. 4: 2839—2847. PMID 2998758
Servenius B., Rask L., Peterson P.A. (1987). Class II genes of the human major histocompatibility complex. The DO beta gene is a divergent member of the class II beta gene family. J. Biol. Chem. 262: 8759—8766. PMID 3036827

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4937 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P13765 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.