HPGDS

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1IYH, 1IYI, 1V40, 2CVD, 2VCQ, 2VCW, 2VCX, 2VCZ, 2VD0, 2VD1, 3EE2, 3KXO, 3VI5, 3VI7, 4EC0, 4EDY, 4EDZ, 4EE0, 5AIS, 5AIV, 5AIX

Ідентифікатори

Символи

HPGDS, GSTS, GSTS1-1, PGD2, PGDS, GSTS1, hematopoietic prostaglandin D synthase

Зовнішні ІД

OMIM: 602598 MGI: 1859384 HomoloGene: 113741 GeneCards: HPGDS

шифр КФ

2.5.1.18

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • calcium ion binding • protein homodimerization activity • isomerase activity • зв'язування з іоном металу • prostaglandin-D synthase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • magnesium ion binding • glutathione transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• prostaglandin metabolic process • locomotory behavior • lipid metabolism • cyclooxygenase pathway • fatty acid metabolic process • fatty acid biosynthetic process • prostaglandin biosynthetic process • glutathione derivative biosynthetic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of male germ cell proliferation • glutathione metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


27306


54486

Ensembl


ENSG00000163106


ENSMUSG00000029919

UniProt


O60760


Q9JHF7

RefSeq (мРНК)


NM_014485


NM_019455

RefSeq (білок)


NP_055300


NP_062328

Локус (UCSC)

Хр. 4: 94.3 – 94.34 Mb

Хр. 6: 65.09 – 65.12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HPGDS (англ. Hematopoietic prostaglandin D synthase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 199 амінокислот, а молекулярна маса — 23 344^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPNYKLTYFN	MRGRAEIIRY	IFAYLDIQYE	DHRIEQADWP	EIKSTLPFGK
IPILEVDGLT	LHQSLAIARY	LTKNTDLAGN	TEMEQCHVDA	IVDTLDDFMS
CFPWAEKKQD	VKEQMFNELL	TYNAPHLMQD	LDTYLGGREW	LIGNSVTWAD
FYWEICSTTL	LVFKPDLLDN	HPRLVTLRKK	VQAIPAVANW	IKRRPQTKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів, біосинтез простагландинів, метаболізм простагландинів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Suzuki T., Watanabe K., Kanaoka Y., Sato T., Hayaishi O. (1997). Induction of hematopoietic prostaglandin D synthase in human megakaryocytic cells by phorbol ester. Biochem. Biophys. Res. Commun. 241: 288—293. PMID 9425264 DOI:10.1006/bbrc.1997.7803
Aritake K., Kado Y., Inoue T., Miyano M., Urade Y. (2006). Structural and functional characterization of HQL-79, an orally selective inhibitor of human hematopoietic prostaglandin D synthase. J. Biol. Chem. 281: 15277—15286. PMID 16547010 DOI:10.1074/jbc.M506431200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17890 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O60760 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.