HSP90B1

HSP90B1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4NH9

Ідентифікатори
Символи HSP90B1, ECGP, GP96, GRP94, HEL-S-125m, HEL35, TRA1, heat shock protein 90kDa beta family member 1, heat shock protein 90 beta family member 1
Зовнішні ІД OMIM: 191175 MGI: 98817 HomoloGene: 2476 GeneCards: HSP90B1
Онтологія гена
Молекулярна функція

nucleotide binding
calcium ion binding
unfolded protein binding
low-density lipoprotein particle receptor binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
RNA binding
protein phosphatase binding
ATP binding

Клітинна компонента

гіалоплазма
endocytic vesicle lumen
endoplasmic reticulum lumen
endoplasmic reticulum membrane
мембрана
focal adhesion
GO:0005578 Позаклітинна матриця
Меланосома
клітинна мембрана
endoplasmic reticulum chaperone complex
extracellular region
midbody
ендоплазматичний ретикулум
perinuclear region of cytoplasm
екзосома
клітинне ядро
GO:0009327 protein-containing complex
collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

response to hypoxia
response to stress
protein folding in endoplasmic reticulum
negative regulation of apoptotic process
рецептор-опосередкований ендоцитоз
response to endoplasmic reticulum stress
toll-like receptor signaling pathway
regulation of phosphoprotein phosphatase activity
ATF6-mediated unfolded protein response
actin rod assembly
retrograde protein transport, ER to cytosol
sequestering of calcium ion
згортання білків
ubiquitin-dependent ERAD pathway
protein transport
cellular response to ATP
посттрансляційна модифікація
cytokine-mediated signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7184
22027
Ensembl
ENSG00000166598
ENSMUSG00000020048
UniProt
P14625
P08113
RefSeq (мРНК)
NM_003299
NM_011631
RefSeq (білок)
NP_003290
NP_035761
Локус (UCSC) Хр. 12: 103.93 – 103.95 Mb Хр. 10: 86.53 – 86.54 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HSP90B1 (англ. Heat shock protein 90 beta family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 803 амінокислот, а молекулярна маса — 92 469[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRALWVLGLCCVLLTFGSVRADDEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQ
REEEAIQLDGLNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIF
LRELISNASDALDKIRLISLTDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDT
GVGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDGQSTSELIGQFGVGFY
SAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSVIADPRGNTLGRGTTITLV
LKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPMEEEEAAK
EEKEESDDEAAVEEEEEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEV
EEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFKSILFVPTSAPRGLFDE
YGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPLNVSRET
LQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDH
SNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAE
SSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDE
SEKTKESREAVEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVAS
QYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRR
IKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNID
PDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDEEMDVGTDEEEETAKESTAEK
DEL

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном кальцію. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі.

Література

  • Maki R.G., Old L.J., Srivastava P.K. (1990). Human homologue of murine tumor rejection antigen gp96: 5'-regulatory and coding regions and relationship to stress-induced proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 5658—5662. PMID 2377606 DOI:10.1073/pnas.87.15.5658
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Chang S.C., Erwin A.E., Lee A.S. (1989). Glucose-regulated protein (GRP94 and GRP78) genes share common regulatory domains and are coordinately regulated by common trans-acting factors. Mol. Cell. Biol. 9: 2153—2162. PMID 2546060 DOI:10.1128/MCB.9.5.2153
  • Meunier L., Usherwood Y.-K., Chung K.T., Hendershot L.M. (2002). A subset of chaperones and folding enzymes form multiprotein complexes in endoplasmic reticulum to bind nascent proteins. Mol. Biol. Cell. 13: 4456—4469. PMID 12475965 DOI:10.1091/mbc.E02-05-0311
  • Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
  • Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12028 (англ.) . Архів оригіналу за 7 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
  4. UniProt, P14625 (англ.) . Архів оригіналу за 7 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
Ця стаття недостатньо чи зовсім не категоризована, або категорії, до яких вона належить, не існують. Будь ласка, допоможіть додати належні категорії, аби цю статтю можна було категоризувати із суміжними сторінками. (січень 2024)