IMPG1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | IMPG1, GP147, IPM150, SPACR, VMD4, interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, RP91 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602870 MGI: 1926876 HomoloGene: 1201 GeneCards: IMPG1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця |
---|
Біологічний процес | • зір |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 75.92 – 76.07 Mb | Хр. 9: 80.22 – 80.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IMPG1 (англ. Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 89 387[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYLETRRAIF | | VFWIFLQVQG | | TKDISINIYH | | SETKDIDNPP | | RNETTESTEK |
MYKMSTMRRI | | FDLAKHRTKR | | SAFFPTGVKV | | CPQESMKQIL | | DSLQAYYRLR |
VCQEAVWEAY | | RIFLDRIPDT | | GEYQDWVSIC | | QQETFCLFDI | | GKNFSNSQEH |
LDLLQQRIKQ | | RSFPDRKDEI | | SAEKTLGEPG | | ETIVISTDVA | | NVSLGPFPLT |
PDDTLLNEIL | | DNTLNDTKMP | | TTERETEFAV | | LEEQRVELSV | | SLVNQKFKAE |
LADSQSPYYQ | | ELAGKSQLQM | | QKIFKKLPGF | | KKIHVLGFRP | | KKEKDGSSST |
EMQLTAIFKR | | HSAEAKSPAS | | DLLSFDSNKI | | ESEEVYHGTM | | EEDKQPEIYL |
TATDLKRLIS | | KALEEEQSLD | | VGTIQFTDEI | | AGSLPAFGPD | | TQSELPTSFA |
VITEDATLSP | | ELPPVEPQLE | | TVDGAEHGLP | | DTSWSPPAMA | | STSLSEAPPF |
FMASSIFSLT | | DQGTTDTMAT | | DQTMLVPGLT | | IPTSDYSAIS | | QLALGISHPP |
ASSDDSRSSA | | GGEDMVRHLD | | EMDLSDTPAP | | SEVPELSEYV | | SVPDHFLEDT |
TPVSALQYIT | | TSSMTIAPKG | | RELVVFFSLR | | VANMAFSNDL | | FNKSSLEYRA |
LEQQFTQLLV | | PYLRSNLTGF | | KQLEILNFRN | | GSVIVNSKMK | | FAKSVPYNLT |
KAVHGVLEDF | | RSAAAQQLHL | | EIDSYSLNIE | | PADQADPCKF | | LACGEFAQCV |
KNERTEEAEC | | RCKPGYDSQG | | SLDGLEPGLC | | GPGTKECEVL | | QGKGAPCRLP |
DHSENQAYKT | | SVKKFQNQQN | | NKVISKRNSE | | LLTVEYEEFN | | HQDWEGN |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Секретований назовні.
Література
- Kuehn M.H., Hageman G.S. (1999). Expression and characterization of the IPM 150 gene (IMPG1) product, a novel human photoreceptor cell-associated chondroitin-sulfate proteoglycan. Matrix Biol. 18: 509—518. PMID 10601738 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00043-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Acharya S., Rayborn M.E., Hollyfield J.G. (1998). Characterization of SPACR, a sialoprotein associated with cones and rods present in the interphotoreceptor matrix of the human retina: immunological and lectin binding analysis. Glycobiology. 8: 997—1006. PMID 9719680 DOI:10.1093/glycob/8.10.997
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6055 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q17R60 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |