ITGA9

Ідентифікатори

Символи

ITGA9, ALPHA-RLC, ITGA4L, RLC, integrin subunit alpha 9

Зовнішні ІД

OMIM: 603963 MGI: 104756 HomoloGene: 1664 GeneCards: ITGA9

Пов'язані генетичні захворювання

бічний аміотрофічний склероз, nasopharynx carcinoma^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • laminin binding • collagen binding
Клітинна компонента	• integrin complex • basal plasma membrane • клітинна мембрана • мембрана • integrin alpha9-beta1 complex • integral component of membrane
Біологічний процес	• Загоєння ран • integrin-mediated signaling pathway • extracellular matrix organization • neutrophil chemotaxis • адгезія клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3680


104099

Ensembl


ENSG00000144668


ENSMUSG00000039115

UniProt


Q13797


B8JK39

RefSeq (мРНК)


NM_002207


NM_001113514 NM_133721

RefSeq (білок)


NP_002198


NP_001106986 NP_598482

Локус (UCSC)

Хр. 3: 37.45 – 37.82 Mb

Хр. 9: 118.44 – 118.73 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ITGA9 (англ. Integrin subunit alpha 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 035 амінокислот, а молекулярна маса — 114 489^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGGPAAPRGA	GRLRALLLAL	VVAGIPAGAY	NLDPQRPVHF	QGPADSFFGY
AVLEHFHDNT	RWVLVGAPKA	DSKYSPSVKS	PGAVFKCRVH	TNPDRRCTEL
DMARGKNRGT	SCGKTCREDR	DDEWMGVSLA	RQPKADGRVL	ACAHRWKNIY
YEADHILPHG	FCYIIPSNLQ	AKGRTLIPCY	EEYKKKYGEE	HGSCQAGIAG
FFTEELVVMG	APGSFYWAGT	IKVLNLTDNT	YLKLNDEVIM	NRRYTYLGYA
VTAGHFSHPS	TIDVVGGAPQ	DKGIGKVYIF	RADRRSGTLI	KIFQASGKKM
GSYFGSSLCA	VDLNGDGLSD	LLVGAPMFSE	IRDEGQVTVY	INRGNGALEE
QLALTGDGAY	NAHFGESIAS	LDDLDNDGFP	DVAIGAPKED	DFAGAVYIYH
GDAGGIVPQY	SMKLSGQKIN	PVLRMFGQSI	SGGIDMDGNG	YPDVTVGAFM
SDSVVLLRAR	PVITVDVSIF	LPGSINITAP	QCHDGQQPVN	CLNVTTCFSF
HGKHVPGEIG	LNYVLMADVA	KKEKGQMPRV	YFVLLGETMG	QVTEKLQLTY
MEETCRHYVA	HVKRRVQDVI	SPIVFEAAYS	LSEHVTGEEE	RELPPLTPVL
RWKKGQKIAQ	KNQTVFERNC	RSEDCAADLQ	LQGKLLLSSM	DEKTLYLALG
AVKNISLNIS	ISNLGDDAYD	ANVSFNVSRE	LFFINMWQKE	EMGISCELLE
SDFLKCSVGF	PFMRSKSKYE	FSVIFDTSHL	SGEEEVLSFI	VTAQSGNTER
SESLHDNTLV	LMVPLMHEVD	TSITGIMSPT	SFVYGESVDA	ANFIQLDDLE
CHFQPINITL	QVYNTGPSTL	PGSSVSISFP	NRLSSGGAEM	FHVQEMVVGQ
EKGNCSFQKN	PTPCIIPQEQ	ENIFHTIFAF	FTKSGRKVLD	CEKPGISCLT
AHCNFSALAK	EESRTIDIYM	LLNTEILKKD	SSSVIQFMSR	AKVKVDPALR
VVEIAHGNPE	EVTVVFEALH	NLEPRGYVVG	WIIAISLLVG	ILIFLLLAVL
LWKMGFFRRR	YKEIIEAEKN	RKENEDSWDW	VQKNQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

Palmer E.L., Rueegg C., Ferrando R., Pytela R., Sheppard D. (1993). Sequence and tissue distribution of the integrin alpha 9 subunit, a novel partner of beta 1 that is widely distributed in epithelia and muscle. J. Cell Biol. 123: 1289—1297. PMID 8245132 DOI:10.1083/jcb.123.5.1289

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITGA9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6145 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13797 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.