LGR5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4BSR, 4BSS, 4BST, 4BSU, 4KNG, 4UFR, 4UFS | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LGR5, FEX, GPR49, GPR67, GRP49, HG38, leucine-rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606667 MGI: 1341817 HomoloGene: 20807 GeneCards: LGR5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G protein-coupled receptor activity • transmembrane signaling receptor activity • signal transducer activity • protein-hormone receptor activity • G protein-coupled peptide receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • integral component of plasma membrane • trans-Golgi network membrane • мембрана |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • hair follicle development • inner ear development • G protein-coupled receptor signaling pathway • epithelial cell proliferation involved in renal tubule morphogenesis • regulation of cell population proliferation • oocyte differentiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • activation of adenylate cyclase activity • hormone-mediated signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001277226 NM_001277227 NM_003667 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001264155 NP_001264156 NP_003658 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 71.44 – 71.59 Mb | Хр. 10: 115.29 – 115.42 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LGR5 (англ. Leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 907 амінокислот, а молекулярна маса — 99 998[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDTSRLGVLL | | SLPVLLQLAT | | GGSSPRSGVL | | LRGCPTHCHC | | EPDGRMLLRV |
DCSDLGLSEL | | PSNLSVFTSY | | LDLSMNNISQ | | LLPNPLPSLR | | FLEELRLAGN |
ALTYIPKGAF | | TGLYSLKVLM | | LQNNQLRHVP | | TEALQNLRSL | | QSLRLDANHI |
SYVPPSCFSG | | LHSLRHLWLD | | DNALTEIPVQ | | AFRSLSALQA | | MTLALNKIHH |
IPDYAFGNLS | | SLVVLHLHNN | | RIHSLGKKCF | | DGLHSLETLD | | LNYNNLDEFP |
TAIRTLSNLK | | ELGFHSNNIR | | SIPEKAFVGN | | PSLITIHFYD | | NPIQFVGRSA |
FQHLPELRTL | | TLNGASQITE | | FPDLTGTANL | | ESLTLTGAQI | | SSLPQTVCNQ |
LPNLQVLDLS | | YNLLEDLPSF | | SVCQKLQKID | | LRHNEIYEIK | | VDTFQQLLSL |
RSLNLAWNKI | | AIIHPNAFST | | LPSLIKLDLS | | SNLLSSFPIT | | GLHGLTHLKL |
TGNHALQSLI | | SSENFPELKV | | IEMPYAYQCC | | AFGVCENAYK | | ISNQWNKGDN |
SSMDDLHKKD | | AGMFQAQDER | | DLEDFLLDFE | | EDLKALHSVQ | | CSPSPGPFKP |
CEHLLDGWLI | | RIGVWTIAVL | | ALTCNALVTS | | TVFRSPLYIS | | PIKLLIGVIA |
AVNMLTGVSS | | AVLAGVDAFT | | FGSFARHGAW | | WENGVGCHVI | | GFLSIFASES |
SVFLLTLAAL | | ERGFSVKYSA | | KFETKAPFSS | | LKVIILLCAL | | LALTMAAVPL |
LGGSKYGASP | | LCLPLPFGEP | | STMGYMVALI | | LLNSLCFLMM | | TIAYTKLYCN |
LDKGDLENIW | | DCSMVKHIAL | | LLFTNCILNC | | PVAFLSFSSL | | INLTFISPEV |
IKFILLVVVP | | LPACLNPLLY | | ILFNPHFKED | | LVSLRKQTYV | | WTRSKHPSLM |
SINSDDVEKQ | | SCDSTQALVT | | FTSSSITYDL | | PPSSVPSPAY | | PVTESCHLSS |
VAFVPCL |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі.
Література
- Hsu S.Y., Liang S.-G., Hsueh A.J.W. (1998). Characterization of two LGR genes homologous to gonadotropin and thyrotropin receptors with extracellular leucine-rich repeats and a G protein-coupled, seven-transmembrane region. Mol. Endocrinol. 12: 1830—1845. PMID 9849958 DOI:10.1210/mend.12.12.0211
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Becker L., Huang Q., Mashimo H. (2008). Immunostaining of Lgr5, an intestinal stem cell marker, in normal and premalignant human gastrointestinal tissue. ScientificWorldJournal. 8: 1168—1176. PMID 19030762 DOI:10.1100/tsw.2008.148
- Carmon K.S., Gong X., Lin Q., Thomas A., Liu Q. (2011). R-spondins function as ligands of the orphan receptors LGR4 and LGR5 to regulate Wnt/beta-catenin signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 11452—11457. PMID 21693646 DOI:10.1073/pnas.1106083108
- Snyder J.C., Rochelle L.K., Lyerly H.K., Caron M.G., Barak L.S. (2013). Constitutive Internalization of the Leucine-rich G Protein-coupled Receptor-5 (LGR5) to the Trans-Golgi Network. J. Biol. Chem. 288: 10286—10297. PMID 23439653 DOI:10.1074/jbc.M112.447540
- Chen P.H., Chen X., Lin Z., Fang D., He X. (2013). The structural basis of R-spondin recognition by LGR5 and RNF43. Genes Dev. 27: 1345—1350. PMID 23756651 DOI:10.1101/gad.219915.113
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4504 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O75473 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |