LNX1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3B76

Ідентифікатори

Символи

LNX1, LNX, MPDZ, PDZRN2, ligand of numb-protein X 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609732 MGI: 1278335 HomoloGene: 7819 GeneCards: LNX1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• PDZ domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • zinc ion binding
Клітинна компонента	• цитоплазма
Біологічний процес	• protein homooligomerization • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84708


16924

Ensembl


ENSG00000072201


ENSMUSG00000029228

UniProt


Q8TBB1


O70263

RefSeq (мРНК)


NM_001126328 NM_032622

NM_001159577 NM_001159578 NM_001159579 NM_001159580 NM_010727
NM_001359074

RefSeq (білок)


NP_001119800 NP_116011

NP_001153049 NP_001153050 NP_001153051 NP_001153052 NP_034857
NP_001346003

Локус (UCSC)

Хр. 4: 53.46 – 53.7 Mb

Хр. 5: 74.75 – 74.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LNX1 (англ. Ligand of numb-protein X 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 728 амінокислот, а молекулярна маса — 80 629^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNQPESANDP	EPLCAVCGQA	HSLEENHFYS	YPEEVDDDLI	CHICLQALLD
PLDTPCGHTY	CTLCLTNFLV	EKDFCPMDRK	PLVLQHCKKS	SILVNKLLNK
LLVTCPFREH	CTQVLQRCDL	EHHFQTSCKG	ASHYGLTKDR	KRRSQDGCPD
GCASLTATAP	SPEVSAAATI	SLMTDEPGLD	NPAYVSSAED	GQPAISPVDS
GRSNRTRARP	FERSTIRSRS	FKKINRALSV	LRRTKSGSAV	ANHADQGREN
SENTTAPEVF	PRLYHLIPDG	EITSIKINRV	DPSESLSIRL	VGGSETPLVH
IIIQHIYRDG	VIARDGRLLP	GDIILKVNGM	DISNVPHNYA	VRLLRQPCQV
LWLTVMREQK	FRSRNNGQAP	DAYRPRDDSF	HVILNKSSPE	EQLGIKLVRK
VDEPGVFIFN	VLDGGVAYRH	GQLEENDRVL	AINGHDLRYG	SPESAAHLIQ
ASERRVHLVV	SRQVRQRSPD	IFQEAGWNSN	GSWSPGPGER	SNTPKPLHPT
ITCHEKVVNI	QKDPGESLGM	TVAGGASHRE	WDLPIYVISV	EPGGVISRDG
RIKTGDILLN	VDGVELTEVS	RSEAVALLKR	TSSSIVLKAL	EVKEYEPQED
CSSPAALDSN	HNMAPPSDWS	PSWVMWLELP	RCLYNCKDIV	LRRNTAGSLG
FCIVGGYEEY	NGNKPFFIKS	IVEGTPAYND	GRIRCGDILL	AVNGRSTSGM
IHACLARLLK	ELKGRITLTI	VSWPGTFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Doyle J.M., Gao J., Wang J., Yang M., Potts P.R. (2010). MAGE-RING protein complexes comprise a family of E3 ubiquitin ligases. Mol. Cell. 39: 963—974. PMID 20864041 DOI:10.1016/j.molcel.2010.08.029

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6657 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8TBB1 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.