LRP1B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | LRP1B, LRP-DIT, LRPDIT, LDL receptor related protein 1B, LRP-1B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608766 MGI: 2151136 HomoloGene: 56810 GeneCards: LRP1B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
періодонтит, рак простати, еректильна дисфункція[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • receptor complex • мембрана |
---|
Біологічний процес | • protein transport • ендоцитоз • рецептор-опосередкований ендоцитоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 140.23 – 142.13 Mb | Хр. 2: 40.49 – 42.54 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LRP1B (англ. LDL receptor related protein 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 599 амінокислот, а молекулярна маса — 515 498[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSEFLLALLT | | LSGLLPIARV | | LTVGADRDQQ | | LCDPGEFLCH | | DHVTCVSQSW |
LCDGDPDCPD | | DSDESLDTCP | | EEVEIKCPLN | | HIACLGTNKC | | VHLSQLCNGV |
LDCPDGYDEG | | VHCQELLSNC | | QQLNCQYKCT | | MVRNSTRCYC | | EDGFEITEDG |
RSCKDQDECA | | VYGTCSQTCR | | NTHGSYTCSC | | VEGYLMQPDN | | RSCKAKIEPT |
DRPPILLIAN | | FETIEVFYLN | | GSKMATLSSV | | NGNEIHTLDF | | IYNEDMICWI |
ESRESSNQLK | | CIQITKAGGL | | TDEWTINILQ | | SFHNVQQMAI | | DWLTRNLYFV |
DHVGDRIFVC | | NSNGSVCVTL | | IDLELHNPKA | | IAVDPIAGKL | | FFTDYGNVAK |
VERCDMDGMN | | RTRIIDSKTE | | QPAALALDLV | | NKLVYWVDLY | | LDYVGVVDYQ |
GKNRHTVIQG | | RQVRHLYGIT | | VFEDYLYATN | | SDNYNIVRIN | | RFNGTDIHSL |
IKIENAWGIR | | IYQKRTQPTV | | RSHACEVDPY | | GMPGGCSHIC | | LLSSSYKTRT |
CRCRTGFNLG | | SDGRSCKRPK | | NELFLFYGKG | | RPGIVRGMDL | | NTKIADEYMI |
PIENLVNPRA | | LDFHAETNYI | | YFADTTSFLI | | GRQKIDGTER | | ETILKDDLDN |
VEGIAVDWIG | | NNLYWTNDGH | | RKTINVARLE | | KASQSRKTLL | | EGEMSHPRGI |
VVDPVNGWMY | | WTDWEEDEID | | DSVGRIEKAW | | MDGFNRQIFV | | TSKMLWPNGL |
TLDFHTNTLY | | WCDAYYDHIE | | KVFLNGTHRK | | IVYSGRELNH | | PFGLSHHGNY |
VFWTDYMNGS | | IFQLDLITSE | | VTLLRHERPP | | LFGLQIYDPR | | KQQGDNMCRV |
NNGGCSTLCL | | AIPGGRVCAC | | ADNQLLDENG | | TTCTFNPGEA | | LPHICKAGEF |
RCKNRHCIQA | | RWKCDGDDDC | | LDGSDEDSVN | | CFNHSCPDDQ | | FKCQNNRCIP |
KRWLCDGAND | | CGSNEDESNQ | | TCTARTCQVD | | QFSCGNGRCI | | PRAWLCDRED |
DCGDQTDEMA | | SCEFPTCEPL | | TQFVCKSGRC | | ISSKWHCDSD | | DDCGDGSDEV |
GCVHSCFDNQ | | FRCSSGRCIP | | GHWACDGDND | | CGDFSDEAQI | | NCTKEEIHSP |
AGCNGNEFQC | | HPDGNCVPDL | | WRCDGEKDCE | | DGSDEKGCNG | | TIRLCDHKTK |
FSCWSTGRCI | | NKAWVCDGDI | | DCEDQSDEDD | | CDSFLCGPPK | | HPCANDTSVC |
LQPEKLCNGK | | KDCPDGSDEG | | YLCDECSLNN | | GGCSNHCSVV | | PGRGIVCSCP |
EGLQLNKDNK | | TCEIVDYCSN | | HLKCSQVCEQ | | HKHTVKCSCY | | EGWKLDVDGE |
SCTSVDPFEA | | FIIFSIRHEI | | RRIDLHKRDY | | SLLVPGLRNT | | IALDFHFNQS |
LLYWTDVVED | | RIYRGKLSES | | GGVSAIEVVV | | EHGLATPEGL | | TVDWIAGNIY |
WIDSNLDQIE | | VAKLDGSLRT | | TLIAGAMEHP | | RAIALDPRYG | | ILFWTDWDAN |
FPRIESASMS | | GAGRKTIYKD | | MKTGAWPNGL | | TVDHFEKRIV | | WTDARSDAIY |
SALYDGTNMI | | EIIRGHEYLS | | HPFAVSLYGS | | EVYWTDWRTN | | TLSKANKWTG |
QNVSVIQKTS | | AQPFDLQIYH | | PSRQPQAPNP | | CAANDGKGPC | | SHMCLINHNR |
SAACACPHLM | | KLSSDKKTCY | | EMKKFLLYAR | | RSEIRGVDID | | NPYFNFITAF |
TVPDIDDVTV | | IDFDASEERL | | YWTDIKTQTI | | KRAFINGTGL | | ETVISRDIQS |
IRGLAVDWVS | | RNLYWISSEF | | DETQINVARL | | DGSLKTSIIH | | GIDKPQCLAA |
HPVRGKLYWT | | DGNTINMANM | | DGSNSKILFQ | | NQKEPVGLSI | | DYVENKLYWI |
SSGNGTINRC | | NLDGGNLEVI | | ESMKEELTKA | | TALTIMDKKL | | WWADQNLAQL |
GTCSKRDGRN | | PTILRNKTSG | | VVHMKVYDKE | | AQQGSNSCQL | | NNGGCSQLCL |
PTSETTRTCM | | CTVGYYLQKN | | RMSCQGIESF | | LMYSVHEGIR | | GIPLEPSDKM |
DALMPISGTS | | FAVGIDFHAE | | NDTIYWTDMG | | FNKISRAKRD | | QTWKEDIITN |
GLGRVEGIAV | | DWIAGNIYWT | | DHGFNLIEVA | | RLNGSFRYVI | | ISQGLDQPRS |
IAVHPEKGLL | | FWTEWGQMPC | | IGKARLDGSE | | KVVLVSMGIA | | WPNGISIDYE |
ENKLYWCDAR | | TDKIERIDLE | | TGGNREMVLS | | GSNVDMFSVA | | VFGAYIYWSD |
RAHANGSVRR | | GHKNDATETI | | TMRTGLGVNL | | KEVKIFNRVR | | EKGTNVCARD |
NGGCKQLCLY | | RGNSRRTCAC | | AHGYLAEDGV | | TCLRHEGYLL | | YSGRTILKSI |
HLSDETNLNS | | PIRPYENPRY | | FKNVIALAFD | | YNQRRKGTNR | | IFYSDAHFGN |
IQLIKDNWED | | RQVIVENVGS | | VEGLAYHRAW | | DTLYWTSSTT | | SSITRHTVDQ |
TRPGAFDREA | | VITMSEDDHP | | HVLALDECQN | | LMFWTNWNEQ | | HPSIMRSTLT |
GKNAQVVVST | | DILTPNGLTI | | DYRAEKLYFS | | DGSLGKIERC | | EYDGSQRHVI |
VKSGPGTFLS | | LAVYDNYIFW | | SDWGRRAILR | | SNKYTGGDTK | | ILRSDIPHQP |
MGIIAVANDT | | NSCELSPCAL | | LNGGCHDLCL | | LTPNGRVNCS | | CRGDRILLED |
NRCVTKNSSC | | NAYSEFECGN | | GECIDYQLTC | | DGIPHCKDKS | | DEKLLYCENR |
SCRRGFKPCY | | NRRCIPHGKL | | CDGENDCGDN | | SDELDCKVST | | CATVEFRCAD |
GTCIPRSARC | | NQNIDCADAS | | DEKNCNNTDC | | THFYKLGVKT | | TGFIRCNSTS |
LCVLPTWICD | | GSNDCGDYSD | | ELKCPVQNKH | | KCEENYFSCP | | SGRCILNTWI |
CDGQKDCEDG | | RDEFHCDSSC | | SWNQFACSAQ | | KCISKHWICD | | GEDDCGDGLD |
ESDSICGAIT | | CAADMFSCQG | | SRACVPRHWL | | CDGERDCPDG | | SDELSTAGCA |
PNNTCDENAF | | MCHNKVCIPK | | QFVCDHDDDC | | GDGSDESPQC | | GYRQCGTEEF |
SCADGRCLLN | | TQWQCDGDFD | | CPDHSDEAPL | | NPKCKSAEQS | | CNSSFFMCKN |
GRCIPSGGLC | | DNKDDCGDGS | | DERNCHINEC | | LSKKVSGCSQ | | DCQDLPVSYK |
CKCWPGFQLK | | DDGKTCVDID | | ECSSGFPCSQ | | QCINTYGTYK | | CLCTDGYEIQ |
PDNPNGCKSL | | SDEEPFLILA | | DHHEIRKIST | | DGSNYTLLKQ | | GLNNVIAIDF |
DYREEFIYWI | | DSSRPNGSRI | | NRMCLNGSDI | | KVVHNTAVPN | | ALAVDWIGKN |
LYWSDTEKRI | | IEVSKLNGLY | | PTILVSKRLK | | FPRDLSLDPQ | | AGYLYWIDCC |
EYPHIGRVGM | | DGTNQSVVIE | | TKISRPMALT | | IDYVNRRLYW | | ADENHIEFSN |
MDGSHRHKVP | | NQDIPGVIAL | | TLFEDYIYWT | | DGKTKSLSRA | | HKTSGADRLS |
LIYSWHAITD | | IQVYHSYRQP | | DVSKHLCMIN | | NGGCSHLCLL | | APGKTHTCAC |
PTNFYLAADN | | RTCLSNCTAS | | QFRCKTDKCI | | PFWWKCDTVD | | DCGDGSDEPD |
DCPEFRCQPG | | RFQCGTGLCA | | LPAFICDGEN | | DCGDNSDELN | | CDTHVCLSGQ |
FKCTKNQKCI | | PVNLRCNGQD | | DCGDEEDERD | | CPENSCSPDY | | FQCKTTKHCI |
SKLWVCDEDP | | DCADASDEAN | | CDKKTCGPHE | | FQCKNNNCIP | | DHWRCDSQND |
CSDNSDEENC | | KPQTCTLKDF | | LCANGDCVSS | | RFWCDGDFDC | | ADGSDERNCE |
TSCSKDQFRC | | SNGQCIPAKW | | KCDGHEDCKY | | GEDEKSCEPA | | SPTCSSREYI |
CASDGCISAS | | LKCNGEYDCA | | DGSDEMDCVT | | ECKEDQFRCK | | NKAHCIPIRW |
LCDGIHDCVD | | GSDEENCERG | | GNICRADEFL | | CNNSLCKLHF | | WVCDGEDDCG |
DNSDEAPDMC | | VKFLCPSTRP | | HRCRNNRICL | | QSEQMCNGID | | ECGDNSDEDH |
CGGKLTYKAR | | PCKKDEFACS | | NKKCIPMDLQ | | CDRLDDCGDG | | SDEQGCRIAP |
TEYTCEDNVN | | PCGDDAYCNQ | | IKTSVFCRCK | | PGFQRNMKNR | | QCEDLNECLV |
FGTCSHQCIN | | VEGSYKCVCD | | QNFQERNNTC | | IAEGSEDQVL | | YIANDTDILG |
FIYPFNYSGD | | HQQISHIEHN | | SRITGMDVYY | | QRDMIIWSTQ | | FNPGGIFYKR |
IHGREKRQAN | | SGLICPEFKR | | PRDIAVDWVA | | GNIYWTDHSR | | MHWFSYYTTH |
WTSLRYSINV | | GQLNGPNCTR | | LLTNMAGEPY | | AIAVNPKRGM | | MYWTVVGDHS |
HIEEAAMDGT | | LRRILVQKNL | | QRPTGLAVDY | | FSERIYWADF | | ELSIIGSVLY |
DGSNSVVSVS | | SKQGLLHPHR | | IDIFEDYIYG | | AGPKNGVFRV | | QKFGHGSVEY |
LALNIDKTKG | | VLISHRYKQL | | DLPNPCLDLA | | CEFLCLLNPS | | GATCVCPEGK |
YLINGTCNDD | | SLLDDSCKLT | | CENGGRCILN | | EKGDLRCHCW | | PSYSGERCEV |
NHCSNYCQNG | | GTCVPSVLGR | | PTCSCALGFT | | GPNCGKTVCE | | DFCQNGGTCI |
VTAGNQPYCH | | CQPEYTGDRC | | QYYVCHHYCV | | NSESCTIGDD | | GSVECVCPTR |
YEGPKCEVDK | | CVRCHGGHCI | | INKDSEDIFC | | NCTNGKIASS | | CQLCDGYCYN |
GGTCQLDPET | | NVPVCLCSTN | | WSGTQCERPA | | PKSSKSDHIS | | TRSIAIIVPL |
VLLVTLITTL | | VIGLVLCKRK | | RRTKTIRRQP | | IINGGINVEI | | GNPSYNMYEV |
DHDHNDGGLL | | DPGFMIDPTK | | ARYIGGGPSA | | FKLPHTAPPI | | YLNSDLKGPL |
TAGPTNYSNP | | VYAKLYMDGQ | | NCRNSLGSVD | | ERKELLPKKI | | EIGIRETVA |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ендоцитоз, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.
Література
- Liu C.-X., Musco S., Lisitsina N.M., Yaklichkin S.Y., Lisitsyn N.A. (2000). Genomic organization of a new candidate tumor suppressor gene, LRP1B. Genomics. 69: 271—274. PMID 11031110 DOI:10.1006/geno.2000.6331
- Liu C.-X., Li Y., Obermoeller-McCormick L.M., Schwartz A.L., Bu G. (2001). The putative tumor suppressor LRP1B, a novel member of the low density lipoprotein (LDL) receptor family, exhibits both overlapping and distinct properties with the LDL receptor-related protein. J. Biol. Chem. 276: 28889—28896. PMID 11384978 DOI:10.1074/jbc.M102727200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LRP1B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6693 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NZR2 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |