NEDD4L

NEDD4L
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2LAJ, 2LB2, 2LTY, 2MPT, 2NSQ, 2ONI, 3JVZ, 3JW0, 5HPK

Ідентифікатори
Символи NEDD4L, NEDD4-2, NEDD4.2, RSP5, hNEDD4-2, neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, PVNH7, NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase
Зовнішні ІД OMIM: 606384 MGI: 1933754 HomoloGene: 86986 GeneCards: NEDD4L
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз, periventricular nodular heterotopia 7; PVNH7, periventricular nodular heterotopia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• potassium channel inhibitor activity
• sodium channel regulator activity
• transmembrane transporter binding
• sodium channel inhibitor activity
• potassium channel regulator activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• transferase activity
• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity

Клітинна компонента

• гіалоплазма
• клітинна мембрана
• внутрішньоклітинний
• нуклеоплазма
• екзосома
• ендосома
• multivesicular body
• комплекс Ґольджі
• цитоплазма

Біологічний процес

• negative regulation of sodium ion transmembrane transport
• диференціація клітин
• positive regulation of caveolin-mediated endocytosis
• виділення
• GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process
• GO:0019067 viral life cycle
• sodium ion transport
• cellular sodium ion homeostasis
• negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity
• regulation of membrane potential
• regulation of ion transmembrane transport
• ventricular cardiac muscle cell action potential
• response to metal ion
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• protein monoubiquitination
• water homeostasis
• regulation of membrane depolarization
• protein K48-linked ubiquitination
• positive regulation of endocytosis
• negative regulation of protein localization to cell surface
• ion transmembrane transport
• negative regulation of potassium ion transmembrane transporter activity
• Убіквітин-залежний протеоліз
• regulation of potassium ion transmembrane transporter activity
• GO:1903362 regulation of protein catabolic process
• negative regulation of potassium ion transmembrane transport
• regulation of membrane repolarization
• positive regulation of dendrite extension
• proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
• protein polyubiquitination
• GO:0022415 viral process
• ubiquitin-dependent protein catabolic process
• regulation of protein stability
• regulation of dendrite morphogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23327
83814
Ensembl
ENSG00000049759
ENSMUSG00000024589
UniProt
Q96PU5
Q8CFI0
RefSeq (мРНК)
NM_001144964
NM_001144965
NM_001144966
NM_001144967
NM_001144968
NM_001144969
NM_001144970
NM_001144971
NM_001243960
NM_015277
NM_001114386
NM_031881
RefSeq (білок)
NP_001138436
NP_001138437
NP_001138438
NP_001138439
NP_001138440
NP_001138441
NP_001138442
NP_001138443
NP_001230889
NP_056092
NP_001107858
NP_114087
NP_001390936
NP_001390937
NP_001390938
NP_001390942
Локус (UCSC) Хр. 18: 58.04 – 58.4 Mb Хр. 18: 64.89 – 65.22 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NEDD4L (англ. Neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 975 амінокислот, а молекулярна маса — 111 932[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MATGLGEPVYGLSEDEGESRILRVKVVSGIDLAKKDIFGASDPYVKLSLY
VADENRELALVQTKTIKKTLNPKWNEEFYFRVNPSNHRLLFEVFDENRLT
RDDFLGQVDVPLSHLPTEDPTMERPYTFKDFLLRPRSHKSRVKGFLRLKM
AYMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSNDSASQHQEELPPPPLPPGWE
EKVDNLGRTYYVNHNNRTTQWHRPSLMDVSSESDNNIRQINQEAAHRRFR
SRRHISEDLEPEPSEGGDVPEPWETISEEVNIAGDSLGLALPPPPASPGS
RTSPQELSEELSRRLQITPDSNGEQFSSLIQREPSSRLRSCSVTDAVAEQ
GHLPPPSAPAGRARSSTVTGGEEPTPSVAYVHTTPGLPSGWEERKDAKGR
TYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSNNHLIEPQIRRPRSLSSP
TVTLSAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLP
PGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNPNDLGPL
PPGWEERIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQK
YDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWI
EFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSG
LCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITLNDME
SVDSEYYNSLKWILENDPTELDLMFCIDEENFGQTYQVDLKPNGSEIMVT
NENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELEL
LMCGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQ
FVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPP
YETFEDLREKLLMAVENAQGFEGVD

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

  • Malbert-Colas L., Nicolas G., Galand C., Lecomte M.-C., Dhermy D. (2003). Identification of new partners of the epithelial sodium channel alpha subunit. C. R. Biol. 326: 615—624. PMID 14556380 DOI:10.1016/S1631-0691(03)00154-9
  • Qi H., Grenier J., Fournier A., Labrie C. (2003). Androgens differentially regulate the expression of NEDD4L transcripts in LNCaP human prostate cancer cells. Mol. Cell. Endocrinol. 210: 51—62. PMID 14615060 DOI:10.1016/j.mce.2003.08.009
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Snyder P.M., Olson D.R., Thomas B.C. (2002). Serum and glucocorticoid-regulated kinase modulates Nedd4-2-mediated inhibition of the epithelial Na+ channel. J. Biol. Chem. 277: 5—8. PMID 11696533 DOI:10.1074/jbc.C100623200
  • Harvey K.F., Shearwin-Whyatt L.M., Fotia A., Parton R.G., Kumar S. (2002). N4WBP5, a potential target for ubiquitination by the Nedd4 family of proteins, is a novel Golgi-associated protein. J. Biol. Chem. 277: 9307—9317. PMID 11748237 DOI:10.1074/jbc.M110443200
  • Snyder P.M., Olson D.R., Kabra R., Zhou R., Steines J.C. (2004). cAMP and serum and glucocorticoid-inducible kinase (SGK) regulate the epithelial Na(+) channel through convergent phosphorylation of Nedd4-2. J. Biol. Chem. 279: 45753—45758. PMID 15328345 DOI:10.1074/jbc.M407858200

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з NEDD4L переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7728 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. ↑ UniProt, Q96PU5 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 18
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.