PCDHGC3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDHGC3, PC43, PCDH-GAMMA-C3, PCDH2, protocadherin gamma subfamily C, 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603627 MGI: 1935201 HomoloGene: 31099 GeneCards: PCDHGC3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку • synapse organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_032403 NM_002588 NM_032402 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_002579 NP_115778 NP_115779 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 141.48 – 141.51 Mb | Хр. 18: 37.94 – 37.97 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDHGC3 (англ. Protocadherin gamma subfamily C, 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 934 амінокислот, а молекулярна маса — 101 077[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVPEAWRSGL | | VSTGRVVGVL | | LLLGALNKAS | | TVIHYEIPEE | | REKGFAVGNV |
VANLGLDLGS | | LSARRFRVVS | | GASRRFFEVN | | RETGEMFVND | | RLDREELCGT |
LPSCTVTLEL | | VVENPLELFS | | VEVVIQDIND | | NNPAFPTQEM | | KLEISEAVAP |
GTRFPLESAH | | DPDVGSNSLQ | | TYELSRNEYF | | ALRVQTREDS | | TKYAELVLER |
ALDREREPSL | | QLVLTALDGG | | TPALSASLPI | | HIKVLDANDN | | APVFNQSLYR |
ARVLEDAPSG | | TRVVQVLATD | | LDEGPNGEII | | YSFGSHNRAG | | VRQLFALDLV |
TGMLTIKGRL | | DFEDTKLHEI | | YIQAKDKGAN | | PEGAHCKVLV | | EVVDVNDNAP |
EITVTSVYSP | | VPEDAPLGTV | | IALLSVTDLD | | AGENGLVTCE | | VPPGLPFSLT |
SSLKNYFTLK | | TSADLDRETV | | PEYNLSITAR | | DAGTPSLSAL | | TIVRVQVSDI |
NDNPPQSSQS | | SYDVYIEENN | | LPGAPILNLS | | VWDPDAPQNA | | RLSFFLLEQG |
AETGLVGRYF | | TINRDNGIVS | | SLVPLDYEDR | | REFELTAHIS | | DGGTPVLATN |
ISVNIFVTDR | | NDNAPQVLYP | | RPGGSSVEML | | PRGTSAGHLV | | SRVVGWDADA |
GHNAWLSYSL | | LGSPNQSLFA | | IGLHTGQIST | | ARPVQDTDSP | | RQTLTVLIKD |
NGEPSLSTTA | | TLTVSVTEDS | | PEARAEFPSG | | SAPREQKKNL | | TFYLLLSLIL |
VSVGFVVTVF | | GVIIFKVYKW | | KQSRDLYRAP | | VSSLYRTPGP | | SLHADAVRGG |
LMSPHLYHQV | | YLTTDSRRSD | | PLLKKPGAAS | | PLASRQNTLR | | SCDPVFYRQV |
LGAESAPPGQ | | QAPPNTDWRF | | SQAQRPGTSG | | SQNGDDTGTW | | PNNQFDTEML |
QAMILASASE | | AADGSSTLGG | | GAGTMGLSAR | | YGPQFTLQHV | | PDYRQNVYIP |
GSNATLTNAA | | GKRDGKAPAG | | GNGNKKKSGK | | KEKK |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8716 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UN70 (англ.) . Архів оригіналу за 5 лютого 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |