PDZRN3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1UHP, 1WH1 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PDZRN3, LNX3, SEMACAP3, SEMCAP3, PDZ domain containing ring finger 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609729 MGI: 1933157 HomoloGene: 10328 GeneCards: PDZRN3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity |
---|
Клітинна компонента | • neuromuscular junction • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • цитоплазма • міжклітинні контакти • синапс |
---|
Біологічний процес | • neuromuscular junction development • Убіквітин-залежний протеоліз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_015009 NM_001303139 NM_001303140 NM_001303141 NM_001303142 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001290068 NP_001290069 NP_001290070 NP_001290071 NP_055824 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 73.38 – 73.62 Mb | Хр. 6: 101.13 – 101.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PDZRN3 (англ. PDZ domain containing ring finger 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 066 амінокислот, а молекулярна маса — 119 596[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGFELDRFDG | | DVDPDLKCAL | | CHKVLEDPLT | | TPCGHVFCAG | | CVLPWVVQEG |
SCPARCRGRL | | SAKELNHVLP | | LKRLILKLDI | | KCAYATRGCG | | RVVKLQQLPE |
HLERCDFAPA | | RCRHAGCGQV | | LLRRDVEAHM | | RDACDARPVG | | RCQEGCGLPL |
THGEQRAGGH | | CCARALRAHN | | GALQARLGAL | | HKALKKEALR | | AGKREKSLVA |
QLAAAQLELQ | | MTALRYQKKF | | TEYSARLDSL | | SRCVAAPPGG | | KGEETKSLTL |
VLHRDSGSLG | | FNIIGGRPSV | | DNHDGSSSEG | | IFVSKIVDSG | | PAAKEGGLQI |
HDRIIEVNGR | | DLSRATHDQA | | VEAFKTAKEP | | IVVQVLRRTP | | RTKMFTPPSE |
SQLVDTGTQT | | DITFEHIMAL | | TKMSSPSPPV | | LDPYLLPEEH | | PSAHEYYDPN |
DYIGDIHQEM | | DREELELEEV | | DLYRMNSQDK | | LGLTVCYRTD | | DEDDIGIYIS |
EIDPNSIAAK | | DGRIREGDRI | | IQINGIEVQN | | REEAVALLTS | | EENKNFSLLI |
ARPELQLDEG | | WMDDDRNDFL | | DDLHMDMLEE | | QHHQAMQFTA | | SVLQQKKHDE |
DGGTTDTATI | | LSNQHEKDSG | | VGRTDESTRN | | DESSEQENNG | | DDATASSNPL |
AGQRKLTCSQ | | DTLGSGDLPF | | SNESFISADC | | TDADYLGIPV | | DECERFRELL |
ELKCQVKSAT | | PYGLYYPSGP | | LDAGKSDPES | | VDKELELLNE | | ELRSIELECL |
SIVRAHKMQQ | | LKEQYRESWM | | LHNSGFRNYN | | TSIDVRRHEL | | SDITELPEKS |
DKDSSSAYNT | | GESCRSTPLT | | LEISPDNSLR | | RAAEGISCPS | | SEGAVGTTEA |
YGPASKNLLS | | ITEDPEVGTP | | TYSPSLKELD | | PNQPLESKER | | RASDGSRSPT |
PSQKLGSAYL | | PSYHHSPYKH | | AHIPAHAQHY | | QSYMQLIQQK | | SAVEYAQSQM |
SLVSMCKDLS | | SPTPSEPRME | | WKVKIRSDGT | | RYITKRPVRD | | RLLRERALKI |
REERSGMTTD | | DDAVSEMKMG | | RYWSKEERKQ | | HLVKAKEQRR | | RREFMMQSRL |
DCLKEQQAAD | | DRKEMNILEL | | SHKKMMKKRN | | KKIFDNWMTI | | QELLTHGTKS |
PDGTRVYNSF | | LSVTTV |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of PDZRN3 and PDZRN4 genes in silico. Int. J. Mol. Med. 13: 607—613. PMID 15010864
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17704 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UPQ7 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |