PLXNB1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2JPH, 2OS6, 2R2O, 2REX, 3HM6, 3OL2, 3SU8, 3SUA | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PLXNB1, PLEXIN-B1, PLXN5, SEP, plexin B1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601053 MGI: 2154238 HomoloGene: 130508 GeneCards: PLXNB1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GTPase activating protein binding • semaphorin receptor activity • semaphorin receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • semaphorin receptor complex • integral component of plasma membrane • extracellular region • внутрішньоклітинний |
---|
Біологічний процес | • ossification involved in bone maturation • negative regulation of cell adhesion • neuron projection morphogenesis • GO:0007243 intracellular signal transduction • positive regulation of axonogenesis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of cell shape • axon extension • negative regulation of osteoblast proliferation • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • cell migration • regulation of cytoskeleton organization • semaphorin-plexin signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • semaphorin-plexin signaling pathway involved in bone trabecula morphogenesis • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of cell migration • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance • inhibitory synapse assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 48.4 – 48.43 Mb | Хр. 9: 108.92 – 108.95 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PLXNB1 (англ. Plexin B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 135 амінокислот, а молекулярна маса — 232 298[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPALGPALLQ | | ALWAGWVLTL | | QPLPPTAFTP | | NGTYLQHLAR | | DPTSGTLYLG |
ATNFLFQLSP | | GLQLEATVST | | GPVLDSRDCL | | PPVMPDECPQ | | AQPTNNPNQL |
LLVSPGALVV | | CGSVHQGVCE | | QRRLGQLEQL | | LLRPERPGDT | | QYVAANDPAV |
STVGLVAQGL | | AGEPLLFVGR | | GYTSRGVGGG | | IPPITTRALW | | PPDPQAAFSY |
EETAKLAVGR | | LSEYSHHFVS | | AFARGASAYF | | LFLRRDLQAQ | | SRAFRAYVSR |
VCLRDQHYYS | | YVELPLACEG | | GRYGLIQAAA | | VATSREVAHG | | EVLFAAFSSA |
APPTVGRPPS | | AAAGASGASA | | LCAFPLDEVD | | RLANRTRDAC | | YTREGRAEDG |
TEVAYIEYDV | | NSDCAQLPVD | | TLDAYPCGSD | | HTPSPMASRV | | PLEATPILEW |
PGIQLTAVAV | | TMEDGHTIAF | | LGDSQGQLHR | | VYLGPGSDGH | | PYSTQSIQQG |
SAVSRDLTFD | | GTFEHLYVMT | | QSTLLKVPVA | | SCAQHLDCAS | | CLAHRDPYCG |
WCVLLGRCSR | | RSECSRGQGP | | EQWLWSFQPE | | LGCLQVAAMS | | PANISREETR |
EVFLSVPDLP | | PLWPGESYSC | | HFGEHQSPAL | | LTGSGVMCPS | | PDPSEAPVLP |
RGADYVSVSV | | ELRFGAVVIA | | KTSLSFYDCV | | AVTELRPSAQ | | CQACVSSRWG |
CNWCVWQHLC | | THKASCDAGP | | MVASHQSPLV | | SPDPPARGGP | | SPSPPTAPKA |
LATPAPDTLP | | VEPGAPSTAT | | ASDISPGASP | | SLLSPWGPWA | | GSGSISSPGS |
TGSPLHEEPS | | PPSPQNGPGT | | AVPAPTDFRP | | SATPEDLLAS | | PLSPSEVAAV |
PPADPGPEAL | | HPTVPLDLPP | | ATVPATTFPG | | AMGSVKPALD | | WLTREGGELP |
EADEWTGGDA | | PAFSTSTLLS | | GDGDSAELEG | | PPAPLILPSS | | LDYQYDTPGL |
WELEEATLGA | | SSCPCVESVQ | | GSTLMPVHVE | | REIRLLGRNL | | HLFQDGPGDN |
ECVMELEGLE | | VVVEARVECE | | PPPDTQCHVT | | CQQHQLSYEA | | LQPELRVGLF |
LRRAGRLRVD | | SAEGLHVVLY | | DCSVGHGDCS | | RCQTAMPQYG | | CVWCEGERPR |
CVTREACGEA | | EAVATQCPAP | | LIHSVEPLTG | | PVDGGTRVTI | | RGSNLGQHVQ |
DVLGMVTVAG | | VPCAVDAQEY | | EVSSSLVCIT | | GASGEEVAGA | | TAVEVPGRGR |
GVSEHDFAYQ | | DPKVHSIFPA | | RGPRAGGTRL | | TLNGSKLLTG | | RLEDIRVVVG |
DQPCHLLPEQ | | QSEQLRCETS | | PRPTPATLPV | | AVWFGATERR | | LQRGQFKYTL |
DPNITSAGPT | | KSFLSGGREI | | CVRGQNLDVV | | QTPRIRVTVV | | SRMLQPSQGL |
GRRRRVVPET | | ACSLGPSCSS | | QQFEEPCHVN | | SSQLITCRTP | | ALPGLPEDPW |
VRVEFILDNL | | VFDFATLNPT | | PFSYEADPTL | | QPLNPEDPTM | | PFRHKPGSVF |
SVEGENLDLA | | MSKEEVVAMI | | GDGPCVVKTL | | TRHHLYCEPP | | VEQPLPRHHA |
LREAPDSLPE | | FTVQMGNLRF | | SLGHVQYDGE | | SPGAFPVAAQ | | VGLGVGTSLL |
ALGVIIIVLM | | YRRKSKQALR | | DYKKVQIQLE | | NLESSVRDRC | | KKEFTDLMTE |
MTDLTSDLLG | | SGIPFLDYKV | | YAERIFFPGH | | RESPLHRDLG | | VPESRRPTVE |
QGLGQLSNLL | | NSKLFLTKFI | | HTLESQRTFS | | ARDRAYVASL | | LTVALHGKLE |
YFTDILRTLL | | SDLVAQYVAK | | NPKLMLRRTE | | TVVEKLLTNW | | MSICLYTFVR |
DSVGEPLYML | | FRGIKHQVDK | | GPVDSVTGKA | | KYTLNDNRLL | | REDVEYRPLT |
LNALLAVGPG | | AGEAQGVPVK | | VLDCDTISQA | | KEKMLDQLYK | | GVPLTQRPDP |
RTLDVEWRSG | | VAGHLILSDE | | DVTSEVQGLW | | RRLNTLQHYK | | VPDGATVALV |
PCLTKHVLRE | | NQDYVPGERT | | PMLEDVDEGG | | IRPWHLVKPS | | DEPEPPRPRR |
GSLRGGERER | | AKAIPEIYLT | | RLLSMKGTLQ | | KFVDDLFQVI | | LSTSRPVPLA |
VKYFFDLLDE | | QAQQHGISDQ | | DTIHIWKTNS | | LPLRFWINII | | KNPQFVFDVQ |
TSDNMDAVLL | | VIAQTFMDAC | | TLADHKLGRD | | SPINKLLYAR | | DIPRYKRMVE |
RYYADIRQTV | | PASDQEMNSV | | LAELSWNYSG | | DLGARVALHE | | LYKYINKYYD |
QIITALEEDG | | TAQKMQLGYR | | LQQIAAAVEN | | KVTDL |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vikis H.G., Li W., He Z., Guan K.-L. (2000). The semaphorin receptor plexin-B1 specifically interacts with active Rac in a ligand-dependent manner. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 12457—12462. PMID 11035813 DOI:10.1073/pnas.220421797
- Aurandt J., Vikis H.G., Gutkind J.S., Ahn N., Guan K.-L. (2002). The semaphorin receptor plexin-B1 signals through a direct interaction with the Rho-specific nucleotide exchange factor, LARG. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12085—12090. PMID 12196628 DOI:10.1073/pnas.142433199
- Oinuma I., Katoh H., Harada A., Negishi M. (2003). Direct interaction of Rnd1 with Plexin-B1 regulates PDZ-RhoGEF-mediated Rho activation by Plexin-B1 and induces cell contraction in COS-7 cells. J. Biol. Chem. 278: 25671—25677. PMID 12730235 DOI:10.1074/jbc.M303047200
- Swiercz J.M., Kuner R., Offermanns S. (2004). Plexin-B1/RhoGEF-mediated RhoA activation involves the receptor tyrosine kinase ErbB-2. J. Cell Biol. 165: 869—880. PMID 15210733 DOI:10.1083/jcb.200312094
- Conrotto P., Corso S., Gamberini S., Comoglio P.M., Giordano S. (2004). Interplay between scatter factor receptors and B plexins controls invasive growth. Oncogene. 23: 5131—5137. PMID 15184888 DOI:10.1038/sj.onc.1207650
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9103 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O43157 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |