PPEF1

Ідентифікатори

Символи

PPEF1, PP7, PPEF, PPP7C, PPP7CA, protein phosphatase with EF-hand domain 1

Зовнішні ІД

OMIM: 300109 MGI: 1097157 HomoloGene: 55960 GeneCards: PPEF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding • calcium ion binding • protein serine/threonine phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • manganese ion binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0016576 protein dephosphorylation • detection of stimulus involved in sensory perception • regulation of rhodopsin mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5475


237178

Ensembl


ENSG00000086717


ENSMUSG00000062168

UniProt


O14829


O35655

RefSeq (мРНК)

NM_006240 NM_152223 NM_152224 NM_152225 NM_152226
NM_001377986 NM_001377993 NM_001377994 NM_001377995 NM_001377996 NM_001378381 NM_001378382 NM_001389620 NM_001389621 NM_001389623 NM_001389624


NM_011147

RefSeq (білок)

NP_006231 NP_689410 NP_689412 NP_001364915 NP_001364922
NP_001364923 NP_001364924 NP_001364925 NP_001365310 NP_001365311


NP_035277

Локус (UCSC)

Хр. X: 18.68 – 18.83 Mb

Хр. X: 159.41 – 159.52 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PPEF1 (англ. Protein phosphatase with EF-hand domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 653 амінокислот, а молекулярна маса — 75 792^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGCSSSSTKT	RRSDTSLRAA	LIIQNWYRGY	KARLKARQHY	ALTIFQSIEY
ADEQGQMQLS	TFFSFMLENY	THIHKEELEL	RNQSLESEQD	MRDRWDYVDS
IDVPDSYNGP	RLQFPLTCTD	IDLLLEAFKE	QQILHAHYVL	EVLFETKKVL
KQMPNFTHIQ	TSPSKEVTIC	GDLHGKLDDL	FLIFYKNGLP	SERNPYVFNG
DFVDRGKNSI	EILMILCVSF	LVYPNDLHLN	RGNHEDFMMN	LRYGFTKEIL
HKYKLHGKRI	LQILEEFYAW	LPIGTIVDNE	ILVIHGGISE	TTDLNLLHRV
ERNKMKSVLI	PPTETNRDHD	TDSKHNKVGV	TFNAHGRIKT	NGSPTEHLTE
HEWEQIIDIL	WSDPRGKNGC	FPNTCRGGGC	YFGPDVTSKI	LNKYQLKMLI
RSHECKPEGY	EICHDGKVVT	IFSASNYYEE	GSNRGAYIKL	CSGTTPRFFQ
YQVTKATCFQ	PLRQRVDTME	NSAIKILRER	VISRKSDLTR	AFQLQDHRKS
GKLSVSQWAF	CMENILGLNL	PWRSLSSNLV	NIDQNGNVEY	MSSFQNIRIE
KPVQEAHSTL	VETLYRYRSD	LEIIFNAIDT	DHSGLISVEE	FRAMWKLFSS
HYNVHIDDSQ	VNKLANIMDL	NKDGSIDFNE	FLKAFYVVHR	YEDLMKPDVT
NLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію, іоном марганцю.

Література

Huang X., Honkanen R.E. (1998). Molecular cloning, expression, and characterization of a novel human serine/threonine protein phosphatase, PP7, that is homologous to Drosophila retinal degeneration C gene product (rdgC). J. Biol. Chem. 273: 1462—1468. PMID 9430683 DOI:10.1074/jbc.273.3.1462
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9243 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O14829 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.