RDH16

Ідентифікатори

Символи

RDH16, RODH-4, SDR9C8, retinol dehydrogenase 16 (all-trans), retinol dehydrogenase 16, hRDH-E

Зовнішні ІД

MGI: 2678390 HomoloGene: 129514 GeneCards: RDH16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• electron transfer activity • oxidoreductase activity • NAD-retinol dehydrogenase activity • androstan-3-alpha,17-beta-diol dehydrogenase activity • protein homodimerization activity • androsterone dehydrogenase activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • organelle membrane • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • ендоплазматичний ретикулум • мембрана
Біологічний процес	• lipid metabolism • Електронтранспортний ланцюг • steroid metabolic process • retinol metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8608


216453

Ensembl


ENSG00000139547


ENSMUSG00000054052

UniProt


O75452


G5E8H9

RefSeq (мРНК)


NM_003708 NM_001320108


NM_147222

RefSeq (білок)


NP_001307037 NP_003699


NP_671755

Локус (UCSC)

Хр. 12: 56.95 – 56.96 Mb

Хр. 10: 127.69 – 127.7 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RDH16 (англ. Retinol dehydrogenase 16 (all-trans)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 317 амінокислот, а молекулярна маса — 35 673^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWLYLAVFVG	LYYLLHWYRE	RQVLSHLRDK	YVFITGCDSG	FGKLLARQLD
ARGLRVLAAC	LTEKGAEQLR	GQTSDRLETV	TLDVTKTESV	AAAAQWVKEC
VRDKGLWGLV	NNAGISLPTA	PNELLTKQDF	VTILDVNLLG	VIDVTLSLLP
LVRRARGRVV	NVSSVMGRVS	LFGGGYCISK	YGVEAFSDSL	RRELSYFGVK
VAMIEPGYFK	TAVTSKERFL	KSFLEIWDRS	SPEVKEAYGE	KFVADYKKSA
EQMEQKCTQD	LSLVTNCMEH	ALIACHPRTR	YSAGWDAKLL	YLPMSYMPTF
LVDAIMYWVS	PSPAKAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

Gough W.H., VanOoteghem S., Sint T., Kedishvili N.Y. (1998). cDNA cloning and characterization of a new human microsomal NAD+-dependent dehydrogenase that oxidizes all-trans-retinol and 3alpha-hydroxysteroids. J. Biol. Chem. 273: 19778—19785. PMID 9677409 DOI:10.1074/jbc.273.31.19778
Lapshina E.A., Belyaeva O.V., Chumakova O.V., Kedishvili N.Y. (2003). Differential recognition of the free versus bound retinol by human microsomal retinol/sterol dehydrogenases: characterization of the holo-CRBP dehydrogenase activity of RoDH-4. Biochemistry. 42: 776—784. PMID 12534290 DOI:10.1021/bi026836r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29674 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O75452 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.