RGS12 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2EBZ, 2KV8 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RGS12, regulator of G protein signaling 12 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602512 MGI: 1918979 HomoloGene: 2195 GeneCards: RGS12 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0005083 GTPase regulator activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0006184 GTPase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • cell projection • nuclear matrix • синапс • condensed nuclear chromosome • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • клітинна мембрана • клітинне ядро • ядерце • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0048552 regulation of catalytic activity • G protein-coupled receptor signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_002926 NM_198227 NM_198229 NM_198230 NM_198430
| NM_198432 NM_198587 NM_001394154 NM_001394155 NM_001394156 NM_001394157 NM_001394158 NM_001394159 NM_001394161 NM_001394162 NM_001394163 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_002917 NP_937870 NP_937872 |
| NP_001156984 NP_775578 NP_001390400 NP_001390401 NP_001390402
| NP_001390403 NP_001390404 NP_001390405 NP_001390406 NP_001390407 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 3.29 – 3.44 Mb | Хр. 5: 35.11 – 35.2 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RGS12 (англ. Regulator of G protein signaling 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 447 амінокислот, а молекулярна маса — 156 357[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFRAGEASKR | | PLPGPSPPRV | | RSVEVARGRA | | GYGFTLSGQA | | PCVLSCVMRG |
SPADFVGLRA | | GDQILAVNEI | | NVKKASHEDV | | VKLIGKCSGV | | LHMVIAEGVG |
RFESCSSDEE | | GGLYEGKGWL | | KPKLDSKALG | | INRAERVVEE | | MQSGGIFNMI |
FENPSLCASN | | SEPLKLKQRS | | LSESAATRFD | | VGHESINNPN | | PNMLSKEEIS |
KVIHDDSVFS | | IGLESHDDFA | | LDASILNVAM | | IVGYLGSIEL | | PSTSSNLESD |
SLQAIRGCMR | | RLRAEQKIHS | | LVTMKIMHDC | | VQLSTDKAGV | | VAEYPAEKLA |
FSAVCPDDRR | | FFGLVTMQTN | | DDGSLAQEEE | | GALRTSCHVF | | MVDPDLFNHK |
IHQGIARRFG | | FECTADPDTN | | GCLEFPASSL | | PVLQFISVLY | | RDMGELIEGM |
RARAFLDGDA | | DAHQNNSTSS | | NSDSGIGNFH | | QEEKSNRVLV | | VDLGGSSSRH |
GPGGSAWDGV | | GGRGAQPWGA | | PWTGPFCPDP | | EGSPPFEAAH | | QTDRFWDLNK |
HLGPASPVEV | | PPASLRSSVP | | PSKRGTVGAG | | CGFNQRWLPV | | HVLREWQCGH |
TSDQDSYTDS | | TDGWSSINCG | | TLPPPMSKIP | | ADRYRVEGSF | | AQPPLNAPKR |
EWSRKAFGMQ | | SIFGPHRNVR | | KTKEDKKGSK | | FGRGTGLTQP | | SQRTSARRSF |
GRSKRFSITR | | SLDDLESATV | | SDGELTGADL | | KDCVSNNSLS | | SNASLPSVQS |
CRRLRERRVA | | SWAVSFERLL | | QDPVGVRYFS | | DFLRKEFSEE | | NILFWQACEY |
FNHVPAHDKK | | ELSYRAREIF | | SKFLCSKATT | | PVNIDSQAQL | | ADDVLRAPHP |
DMFKEQQLQI | | FNLMKFDSYT | | RFLKSPLYQE | | CILAEVEGRA | | LPDSQQVPSS |
PASKHSLGSD | | HSSVSTPKKL | | SGKSKSGRSL | | NEELGDEDSE | | KKRKGAFFSW |
SRTRSTGRSQ | | KKREHGDHAD | | DALHANGGLC | | RRESQGSVSS | | AGSLDLSEAC |
RTLAPEKDKA | | TKHCCIHLPD | | GTSCVVAVKA | | GFSIKDILSG | | LCERHGINGA |
AADLFLVGGD | | KPLVLHQDSS | | ILESRDLRLE | | KRTLFRLDLV | | PINRSVGLKA |
KPTKPVTEVL | | RPVVARYGLD | | LSGLLVRLSG | | EKEPLDLGAP | | ISSLDGQRVV |
LEEKDPSRGK | | ASADKQKGVP | | VKQNTAVNSS | | SRNHSATGEE | | RTLGKSNSIK |
IKGENGKNAR | | DPRLSKREES | | IAKIGKKKYQ | | KINLDEAEEF | | FELISKAQSN |
RADDQRGLLR | | KEDLVLPEFL | | RLPPGSTELT | | LPTPAAVAKG | | FSKRSATGNG |
RESASQPGEQ | | WEPVQESSDS | | PSTSPGSASS | | PPGPPGTTPP | | GQKSPSGPFC |
TPQSPVSLAQ | | EGTAQIWKRQ | | SQEVEAGGIQ | | TVEDEHVAEL | | TLMGEGDISS |
PNSTLLPPPS | | TPQEVPGPSR | | PGSGTHGSRD | | LPVNRIIDVD | | LVTGSAPGRD |
GGIAGAQAGP | | GRSQASGGPP | | TSDLPGLGPV | | PGEPAKPKTS | | AHHATFV |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів, інгібіторів трансдукції сигналу. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.
Література
- Chatterjee T.K., Fisher R.A. (2000). Novel alternative splicing and nuclear localization of human RGS12 gene products. J. Biol. Chem. 275: 29660—29671. PMID 10869340 DOI:10.1074/jbc.M000330200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chatterjee T.K., Fisher R.A. (2002). RGS12TS-S localizes at nuclear matrix-associated subnuclear structures and represses transcription: structural requirements for subnuclear targeting and transcriptional repression. Mol. Cell. Biol. 22: 4334—4345. PMID 12024043 DOI:10.1128/MCB.22.12.4334-4345.2002
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9994 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O14924 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |