RNF20

Ідентифікатори

Символи

RNF20, BRE1, BRE1A, hBRE1, ring finger protein 20

Зовнішні ІД

OMIM: 607699 MGI: 1925927 HomoloGene: 5571 GeneCards: RNF20

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0031493 histone binding • p53 binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • mRNA 3'-UTR binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
Клітинна компонента	• ubiquitin ligase complex • HULC complex • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of mRNA polyadenylation • positive regulation of histone methylation • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell migration • regulation of mitotic cell cycle • histone H2B ubiquitination • positive regulation of histone H2B ubiquitination • histone ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • histone monoubiquitination • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56254


109331

Ensembl


ENSG00000155827


ENSMUSG00000028309

UniProt


Q5VTR2


Q5DTM8

RefSeq (мРНК)


NM_019592


NM_001163263 NM_182999 NM_001356401

RefSeq (білок)


NP_062538


NP_001156735 NP_892044 NP_001343330

Локус (UCSC)

Хр. 9: 101.53 – 101.56 Mb

Хр. 4: 49.63 – 49.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNF20 (англ. Ring finger protein 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 975 амінокислот, а молекулярна маса — 113 662^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGIGNKRAA	GEPGTSMPPE	KKAAVEDSGT	TVETIKLGGV	SSTEELDIRT
LQTKNRKLAE	MLDQRQAIED	ELREHIEKLE	RRQATDDASL	LIVNRYWSQF
DENIRIILKR	YDLEQGLGDL	LTERKALVVP	EPEPDSDSNQ	ERKDDRERGE
GQEPAFSFLA	TLASSSSEEM	ESQLQERVES	SRRAVSQIVT	VYDKLQEKVE
LLSRKLNSGD	NLIVEEAVQE	LNSFLAQENM	RLQELTDLLQ	EKHRTMSQEF
SKLQSKVETA	ESRVSVLESM	IDDLQWDIDK	IRKREQRLNR	HLAEVLERVN
SKGYKVYGAG	SSLYGGTITI	NARKFEEMNA	ELEENKELAQ	NRLCELEKLR
QDFEEVTTQN	EKLKVELRSA	VEQVVKETPE	YRCMQSQFSV	LYNESLQLKA
HLDEARTLLH	GTRGTHQHQV	ELIERDEVSL	HKKLRTEVIQ	LEDTLAQVRK
EYEMLRIEFE	QTLAANEQAG	PINREMRHLI	SSLQNHNHQL	KGEVLRYKRK
LREAQSDLNK	TRLRSGSALL	QSQSSTEDPK	DEPAELKPDS	EDLSSQSSAS
KASQEDANEI	KSKRDEEERE	RERREKERER	EREREKEKER	EREKQKLKES
EKERDSAKDK	EKGKHDDGRK	KEAEIIKQLK	IELKKAQESQ	KEMKLLLDMY
RSAPKEQRDK	VQLMAAEKKS	KAELEDLRQR	LKDLEDKEKK	ENKKMADEDA
LRKIRAVEEQ	IEYLQKKLAM	AKQEEEALLS	EMDVTGQAFE	DMQEQNIRLM
QQLREKDDAN	FKLMSERIKS	NQIHKLLKEE	KEELADQVLT	LKTQVDAQLQ
VVRKLEEKEH	LLQSNIGTGE	KELGLRTQAL	EMNKRKAMEA	AQLADDLKAQ
LELAQKKLHD	FQDEIVENSV	TKEKDMFNFK	RAQEDISRLR	RKLETTKKPD
NVPKCDEILM	EEIKDYKARL	TCPCCNMRKK	DAVLTKCFHV	FCFECVKTRY
DTRQRKCPKC	NAAFGANDFH	RIYIG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kim J., Hake S.B., Roeder R.G. (2005). The human homolog of yeast BRE1 functions as a transcriptional coactivator through direct activator interactions. Mol. Cell. 20: 759—770. PMID 16337599 DOI:10.1016/j.molcel.2005.11.012
Zhang F., Yu X. (2011). WAC, a functional partner of RNF20/40, regulates histone H2B ubiquitination and gene transcription. Mol. Cell. 41: 384—397. PMID 21329877 DOI:10.1016/j.molcel.2011.01.024

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10062 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5VTR2 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.