ROBO2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1UEM, 1UJT, 2EDJ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ROBO2, SAX3, roundabout guidance receptor 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602431 MGI: 1890110 HomoloGene: 43188 GeneCards: ROBO2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
періодонтит[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • axon guidance receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • cell surface • axolemma • екзосома • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • ureteric bud development • розвиток нирки • negative regulation of synapse assembly • Roundabout signaling pathway • positive regulation of axonogenesis • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • хемотаксис • central nervous system development • cellular response to hormone stimulus • olfactory bulb interneuron development • apoptotic process involved in luteolysis • negative regulation of negative chemotaxis • axon midline choice point recognition • metanephros development • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • retinal ganglion cell axon guidance • brain development • spinal cord development • axon guidance • outflow tract septum morphogenesis • aortic valve morphogenesis • pulmonary valve morphogenesis • endocardial cushion formation • positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction • aorta development • ventricular septum morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001128929 NM_001290039 NM_001290040 NM_001290065 NM_002942
| NM_001378190 NM_001378191 NM_001378192 NM_001378193 NM_001378194 NM_001378195 NM_001378196 NM_001378197 NM_001378198 NM_001378199 NM_001378200 NM_001378201 NM_001378202 NM_001378203 NM_001394212 NM_001394213 NM_001394214 NM_001395656 NM_001395657 |
| NM_175549 NM_001358490 NM_001358491 NM_001358492 NM_001358493
| NM_001358494 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001122401 NP_001276968 NP_001276969 NP_001276994 NP_002933
| NP_001365119 NP_001365120 NP_001365121 NP_001365122 NP_001365123 NP_001365124 NP_001365125 NP_001365126 NP_001365127 NP_001365128 NP_001365129 NP_001365130 NP_001365131 NP_001365132 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 75.91 – 77.65 Mb | Хр. 16: 73.69 – 74.21 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ROBO2 (англ. Roundabout guidance receptor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 378 амінокислот, а молекулярна маса — 151 200[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSLLMFTQLL | | LCGFLYVRVD | | GSRLRQEDFP | | PRIVEHPSDV | | IVSKGEPTTL |
NCKAEGRPTP | | TIEWYKDGER | | VETDKDDPRS | | HRMLLPSGSL | | FFLRIVHGRR |
SKPDEGSYVC | | VARNYLGEAV | | SRNASLEVAL | | LRDDFRQNPT | | DVVVAAGEPA |
ILECQPPRGH | | PEPTIYWKKD | | KVRIDDKEER | | ISIRGGKLMI | | SNTRKSDAGM |
YTCVGTNMVG | | ERDSDPAELT | | VFERPTFLRR | | PINQVVLEEE | | AVEFRCQVQG |
DPQPTVRWKK | | DDADLPRGRY | | DIKDDYTLRI | | KKTMSTDEGT | | YMCIAENRVG |
KMEASATLTV | | RAPPQFVVRP | | RDQIVAQGRT | | VTFPCETKGN | | PQPAVFWQKE |
GSQNLLFPNQ | | PQQPNSRCSV | | SPTGDLTITN | | IQRSDAGYYI | | CQALTVAGSI |
LAKAQLEVTD | | VLTDRPPPII | | LQGPANQTLA | | VDGTALLKCK | | ATGDPLPVIS |
WLKEGFTFPG | | RDPRATIQEQ | | GTLQIKNLRI | | SDTGTYTCVA | | TSSSGETSWS |
AVLDVTESGA | | TISKNYDLSD | | LPGPPSKPQV | | TDVTKNSVTL | | SWQPGTPGTL |
PASAYIIEAF | | SQSVSNSWQT | | VANHVKTTLY | | TVRGLRPNTI | | YLFMVRAINP |
QGLSDPSPMS | | DPVRTQDISP | | PAQGVDHRQV | | QKELGDVLVR | | LHNPVVLTPT |
TVQVTWTVDR | | QPQFIQGYRV | | MYRQTSGLQA | | TSSWQNLDAK | | VPTERSAVLV |
NLKKGVTYEI | | KVRPYFNEFQ | | GMDSESKTVR | | TTEEAPSAPP | | QSVTVLTVGS |
YNSTSISVSW | | DPPPPDHQNG | | IIQEYKIWCL | | GNETRFHINK | | TVDAAIRSVI |
IGGLFPGIQY | | RVEVAASTSA | | GVGVKSEPQP | | IIIGRRNEVV | | ITENNNSITE |
QITDVVKQPA | | FIAGIGGACW | | VILMGFSIWL | | YWRRKKRKGL | | SNYAVTFQRG |
DGGLMSNGSR | | PGLLNAGDPS | | YPWLADSWPA | | TSLPVNNSNS | | GPNEIGNFGR |
GDVLPPVPGQ | | GDKTATMLSD | | GAIYSSIDFT | | TKTSYNSSSQ | | ITQATPYATT |
QILHSNSIHE | | LAVDLPDPQW | | KSSIQQKTDL | | MGFGYSLPDQ | | NKGNNGGKGG |
KKKKNKNSSK | | PQKNNGSTWA | | NVPLPPPPVQ | | PLPGTELEHY | | AVEQQENGYD |
SDSWCPPLPV | | QTYLHQGLED | | ELEEDDDRVP | | TPPVRGVASS | | PAISFGQQST |
ATLTPSPREE | | MQPMLQAHLD | | ELTRAYQFDI | | AKQTWHIQSN | | NQPPQPPVPP |
LGYVSGALIS | | DLETDVADDD | | ADDEEEALEI | | PRPLRALDQT | | PGSSMDNLDS |
SVTGKAFTSS | | QRPRPTSPFS | | TDSNTSAALS | | QSQRPRPTKK | | HKGGRMDQQP |
ALPHRREGMT | | DEEALVPYSK | | PSFPSPGGHS | | SSGTASSKGS | | TGPRKTEVLR |
AGHQRNASDL | | LDIGYMGSNS | | QGQFTGEL |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як хемотаксис, диференціація, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.
Література
- Yue Y., Grossmann B., Galetzka D., Zechner U., Haaf T. (2006). Isolation and differential expression of two isoforms of the ROBO2/Robo2 axon guidance receptor gene in humans and mice. Genomics. 88: 772—778. PMID 16829019 DOI:10.1016/j.ygeno.2006.05.011
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ROBO2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10250 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9HCK4 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |