S100A1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2L0P, 2LHL, 2LLS, 2LLT, 2LLU, 2LP2, 2LP3, 2LUX, 2M3W

Ідентифікатори

Символи

S100A1, S100, S100-alpha, S100A, S100 calcium-binding protein A1, S100 calcium binding protein A1

Зовнішні ІД

OMIM: 176940 MGI: 1338917 HomoloGene: 4566 GeneCards: S100A1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • S100 protein binding • protein homodimerization activity • ATPase binding • calcium-dependent protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • M band • I band • sarcoplasmic reticulum • Z discdkac • neuron projection • A band • клітинне ядро • extracellular region • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of heart contraction • substantia nigra development • positive regulation of voltage-gated calcium channel activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • positive regulation of sprouting angiogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6271


20193

Ensembl


ENSG00000160678


ENSMUSG00000044080

UniProt


P23297


P56565

RefSeq (мРНК)


NM_006271


NM_011309

RefSeq (білок)


NP_006262


NP_035439

Локус (UCSC)

Хр. 1: 153.63 – 153.63 Mb

Хр. 3: 90.42 – 90.42 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

S100A1 (англ. S100 calcium binding protein A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 94 амінокислот, а молекулярна маса — 10 546^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSELETAME		TLINVFHAHS		GKEGDKYKLS		KKELKELLQT		ELSGFLDAQK
DVDAVDKVMK		ELDENGDGEV		DFQEYVVLVA		ALTVACNNFF		WENS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Engelkamp D., Schaefer B.W., Erne P., Heizmann C.W. (1992). S100 alpha, CAPL, and CACY: molecular cloning and expression analysis of three calcium-binding proteins from human heart. Biochemistry. 31: 10258—10264. PMID 1384693 DOI:10.1021/bi00157a012
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Filipek A., Jastrzebska B., Nowotny M., Kuznicki J. (2002). CacyBP/SIP, a calcyclin and Siah-1-interacting protein, binds EF-hand proteins of the S100 family. J. Biol. Chem. 277: 28848—28852. PMID 12042313 DOI:10.1074/jbc.M203602200
Shimamoto S., Kubota Y., Tokumitsu H., Kobayashi R. (2010). S100 proteins regulate the interaction of Hsp90 with cyclophilin 40 and FKBP52 through their tetratricopeptide repeats. FEBS Lett. 584: 1119—1125. PMID 20188096 DOI:10.1016/j.febslet.2010.02.055

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10486 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P23297 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.