S100A12 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1E8A, 1GQM, 1ODB, 2M9G, 2WC8, 2WCB, 2WCE, 2WCF | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | S100A12, CAAF1, CAGC, CGRP, ENRAGE, MRP-6, MRP6, p6, S100 calcium binding protein A12, EN-RAGE |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603112 HomoloGene: 48361 GeneCards: S100A12 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RAGE receptor binding • copper ion binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • extracellular region • цитоскелет • клітинне ядро • secretory granule lumen |
---|
Біологічний процес | • mast cell activation • positive regulation of inflammatory response • positive regulation of MAP kinase activity • monocyte chemotaxis • процес імунної системи • defense response to fungus • neutrophil chemotaxis • defense response to bacterium • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • xenobiotic metabolic process • вроджений імунітет • inflammatory response • neutrophil degranulation • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • killing of cells of other organism |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 153.37 – 153.38 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | н/д |
---|
Вікідані |
|
S100A12 (англ. S100 calcium binding protein A12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 92 амінокислот, а молекулярна маса — 10 575[3].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTKLEEHLEG | | IVNIFHQYSV | | RKGHFDTLSK | | GELKQLLTKE | | LANTIKNIKD |
KAVIDEIFQG | | LDANQDEQVD | | FQEFISLVAI | | ALKAAHYHTH | | KE |
Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Wicki R., Marenholz I., Mischke D., Schaefer B.W., Heizmann C.W. (1996). Characterization of the human S100A12 (calgranulin C, p6, CAAF1, CGRP) gene, a new member of the S100 gene cluster on chromosome 1q21. Cell Calcium. 20: 459—464. PMID 8985590 DOI:10.1016/S0143-4160(96)90087-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Marti T., Erttmann K.D., Gallin M.Y. (1996). Host-parasite interaction in human onchocerciasis: identification and sequence analysis of a novel human calgranulin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 221: 454—458. PMID 8619876 DOI:10.1006/bbrc.1996.0616
- Guignard F., Mauel J., Markert M. (1995). Identification and characterization of a novel human neutrophil protein related to the S100 family. Biochem. J. 309: 395—401. PMID 7626002 DOI:10.1042/bj3090395
- Filipek A., Jastrzebska B., Nowotny M., Kuznicki J. (2002). CacyBP/SIP, a calcyclin and Siah-1-interacting protein, binds EF-hand proteins of the S100 family. J. Biol. Chem. 277: 28848—28852. PMID 12042313 DOI:10.1074/jbc.M203602200
- Moroz O.V., Dodson G.G., Wilson K.S., Lukanidin E., Bronstein I.B. (2003). Multiple structural states of S100A12: A key to its functional diversity. Microsc. Res. Tech. 60: 581—592. PMID 12645006 DOI:10.1002/jemt.10300
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10489 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P80511 (англ.) . Архів оригіналу за 8 травня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |