SKP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1FQV, 1FS1, 1FS2, 1LDK, 2ASS, 2AST

Ідентифікатори

Символи

SKP2, FBL1, FBXL1, FLB1, p45, S-phase kinase-associated protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, S-phase kinase associated protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 601436 MGI: 1351663 HomoloGene: 55942 GeneCards: SKP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • ядерце • SCF ubiquitin ligase complex • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • cellular response to cell-matrix adhesion • positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of cell cycle • G2/M transition of mitotic cell cycle • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of protein polyubiquitination • проліферація • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • protein polyubiquitination • protein deubiquitination • посттрансляційна модифікація • G1/S transition of mitotic cell cycle • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • вроджений імунітет • defense response to virus • protein K48-linked ubiquitination • процес імунної системи • GO:0022415 viral process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6502


27401

Ensembl


ENSG00000145604


ENSMUSG00000054115

UniProt


Q13309


Q9Z0Z3

RefSeq (мРНК)


NM_001243120 NM_005983 NM_032637


NM_001285980 NM_013787 NM_145468

RefSeq (білок)


NP_001230049 NP_005974 NP_116026


NP_001272909 NP_038815

Локус (UCSC)

Хр. 5: 36.15 – 36.2 Mb

Хр. 15: 9.11 – 9.16 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SKP2 (англ. S-phase kinase associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 424 амінокислот, а молекулярна маса — 47 761^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHRKHLQEIP	DLSSNVATSF	TWGWDSSKTS	ELLSGMGVSA	LEKEEPDSEN
IPQELLSNLG	HPESPPRKRL	KSKGSDKDFV	IVRRPKLNRE	NFPGVSWDSL
PDELLLGIFS	CLCLPELLKV	SGVCKRWYRL	ASDESLWQTL	DLTGKNLHPD
VTGRLLSQGV	IAFRCPRSFM	DQPLAEHFSP	FRVQHMDLSN	SVIEVSTLHG
ILSQCSKLQN	LSLEGLRLSD	PIVNTLAKNS	NLVRLNLSGC	SGFSEFALQT
LLSSCSRLDE	LNLSWCFDFT	EKHVQVAVAH	VSETITQLNL	SGYRKNLQKS
DLSTLVRRCP	NLVHLDLSDS	VMLKNDCFQE	FFQLNYLQHL	SLSRCYDIIP
ETLLELGEIP	TLKTLQVFGI	VPDGTLQLLK	EALPHLQINC	SHFTTIARPT
IGNKKNQEIW	GIKCRLTLQK	PSCL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Zhang H., Kobayashi R., Galaktionov K., Beach D. (1995). p19Skp1 and p45Skp2 are essential elements of the cyclin A-CDK2 S phase kinase. Cell. 82: 915—925. PMID 7553852 DOI:10.1016/0092-8674(95)90271-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tedesco D., Lukas J., Reed S.I. (2002). The pRb-related protein p130 is regulated by phosphorylation-dependent proteolysis via the protein-ubiquitin ligase SCF(Skp2). Genes Dev. 16: 2946—2957. PMID 12435635 DOI:10.1101/gad.1011202
Li X., Zhao Q., Liao R., Sun P., Wu X. (2003). The SCF(Skp2) ubiquitin ligase complex interacts with the human replication licensing factor Cdt1 and regulates Cdt1 degradation. J. Biol. Chem. 278: 30854—30858. PMID 12840033 DOI:10.1074/jbc.C300251200
Wang W., Nacusi L., Sheaff R.J., Liu X. (2005). Ubiquitination of p21Cip1/WAF1 by SCFSkp2: substrate requirement and ubiquitination site selection. Biochemistry. 44: 14553—14564. PMID 16262255 DOI:10.1021/bi051071j
Barboric M., Zhang F., Besenicar M., Plemenitas A., Peterlin B.M. (2005). Ubiquitylation of Cdk9 by Skp2 facilitates optimal Tat transactivation. J. Virol. 79: 11135—11141. PMID 16103164 DOI:10.1128/JVI.79.17.11135-11141.2005

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10901 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13309 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.