SMURF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2LAZ, 2LB0, 2LB1, 2LTX, 3PYC

Ідентифікатори

Символи

SMURF1, SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605568 MGI: 1923038 HomoloGene: 10712 GeneCards: SMURF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• R-SMAD binding • I-SMAD binding • activin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phospholipid binding • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • нуклеоплазма • аксон • neuronal cell body • мітохондрія • екзосома
Біологічний процес	• диференціація клітин • engulfment of target by autophagosome • ectoderm development • protein polyubiquitination • BMP signaling pathway • receptor catabolic process • ubiquitin-dependent SMAD protein catabolic process • negative regulation of ossification • protein localization to cell surface • protein targeting to vacuole involved in autophagy • positive regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • protein export from nucleus • positive regulation of dendrite extension • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • parkin-mediated stimulation of mitophagy in response to mitochondrial depolarization • substrate localization to autophagosome • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of BMP signaling pathway • protein localization to plasma membrane • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57154


75788

Ensembl


ENSG00000284126 ENSG00000198742


ENSMUSG00000038780

UniProt


Q9HCE7


Q9CUN6

RefSeq (мРНК)


NM_001199847 NM_020429 NM_181349


NM_001038627 NM_029438

RefSeq (білок)


NP_001186776 NP_065162 NP_851994


NP_001033716 NP_083714

Локус (UCSC)

Хр. 7: 99.03 – 99.14 Mb

Хр. 5: 144.81 – 144.9 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SMURF1 (англ. SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 757 амінокислот, а молекулярна маса — 86 114^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSNPGTRRNG	SSIKIRLTVL	CAKNLAKKDF	FRLPDPFAKI	VVDGSGQCHS
TDTVKNTLDP	KWNQHYDLYV	GKTDSITISV	WNHKKIHKKQ	GAGFLGCVRL
LSNAISRLKD	TGYQRLDLCK	LNPSDTDAVR	GQIVVSLQTR	DRIGTGGSVV
DCRGLLENEG	TVYEDSGPGR	PLSCFMEEPA	PYTDSTGAAA	GGGNCRFVES
PSQDQRLQAQ	RLRNPDVRGS	LQTPQNRPHG	HQSPELPEGY	EQRTTVQGQV
YFLHTQTGVS	TWHDPRIPSP	SGTIPGGDAA	FLYEFLLQGH	TSEPRDLNSV
NCDELGPLPP	GWEVRSTVSG	RIYFVDHNNR	TTQFTDPRLH	HIMNHQCQLK
EPSQPLPLPS	EGSLEDEELP	AQRYERDLVQ	KLKVLRHELS	LQQPQAGHCR
IEVSREEIFE	ESYRQIMKMR	PKDLKKRLMV	KFRGEEGLDY	GGVAREWLYL
LCHEMLNPYY	GLFQYSTDNI	YMLQINPDSS	INPDHLSYFH	FVGRIMGLAV
FHGHYINGGF	TVPFYKQLLG	KPIQLSDLES	VDPELHKSLV	WILENDITPV
LDHTFCVEHN	AFGRILQHEL	KPNGRNVPVT	EENKKEYVRL	YVNWRFMRGI
EAQFLALQKG	FNELIPQHLL	KPFDQKELEL	IIGGLDKIDL	NDWKSNTRLK
HCVADSNIVR	WFWQAVETFD	EERRARLLQF	VTGSTRVPLQ	GFKALQGSTG
AAGPRLFTIH	LIDANTDNLP	KAHTCFNRID	IPPYESYEKL	YEKLLTAVEE
TCGFAVE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhu H., Kavsak P., Abdollah S., Wrana J.L., Thomsen G.H. (1999). A SMAD ubiquitin ligase targets the BMP pathway and affects embryonic pattern formation. Nature. 400: 687—693. PMID 10458166 DOI:10.1038/23293
Wang Y., Tong X., Ye X. (2012). Ndfip1 negatively regulates RIG-I-dependent immune signaling by enhancing E3 ligase Smurf1-mediated MAVS degradation. J. Immunol. 189: 5304—5313. PMID 23087404 DOI:10.4049/jimmunol.1201445

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16807 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HCE7 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.