SNCAIP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KES

Ідентифікатори

Символи

SNCAIP, SYPH1, Sph1, synuclein alpha interacting protein

Зовнішні ІД

OMIM: 603779 MGI: 1915097 HomoloGene: 3987 GeneCards: SNCAIP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • neuronal cell body • presynaptic membrane • Синаптичні бульбашки • нуклеоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Біологічний процес	• regulation of inclusion body assembly • dopamine metabolic process • смерть клітини • regulation of neurotransmitter secretion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9627


67847

Ensembl


ENSG00000064692


ENSMUSG00000024534

UniProt


Q9Y6H5


Q99ME3

RefSeq (мРНК)

NM_001242935 NM_001308100 NM_001308105 NM_001308106 NM_001308107
NM_001308108 NM_001308109 NM_005460


NM_001199151 NM_001199153 NM_001199154 NM_026408

RefSeq (білок)

NP_001229864 NP_001295029 NP_001295034 NP_001295035 NP_001295036
NP_001295037 NP_001295038 NP_005451

NP_001186080 NP_001186082 NP_001186083 NP_080684 NP_001390575
NP_001390576 NP_001390577

Локус (UCSC)

Хр. 5: 122.31 – 122.46 Mb

Хр. 18: 52.9 – 53.05 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNCAIP (англ. Synuclein alpha interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 100 409^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAPEYLDLD	EIDFSDDISY	SVTSLKTIPE	LCRRCDTQNE	DRSVSSSSWN
CGISTLITNT	QKPTGIADVY	SKFRPVKRVS	PLKHQPETLE	NNESDDQKNQ
KVVEYQKGGE	SDLGPQPQEL	GPGDGVGGPP	GKSSEPSTSL	GELEHYDLDM
DEILDVPYIK	SSQQLASFTK	VTSEKRILGL	CTTINGLSGK	ACSTGSSESS
SSNMAPFCVL	SPVKSPHLRK	ASAVIHDQHK	LSTEETEISP	PLVKCGSAYE
PENQSKDFLN	KTFSDPHGRK	VEKTTPDCQL	RAFHLQSSAA	ESKPEEQVSG
LNRTSSQGPE	ERSEYLKKVK	SILNIVKEGQ	ISLLPHLAAD	NLDKIHDENG
NNLLHIAASQ	GHAECLQHLT	SLMGEDCLNE	RNTEKLTPAG	LAIKNGQLEC
VRWMVSETEA	IAELSCSKDF	PSLIHYAGCY	GQEKILLWLL	QFMQEQGISL
DEVDQDGNSA	VHVASQHGYL	GCIQTLVEYG	ANVTMQNHAG	EKPSQSAERQ
GHTLCSRYLV	VVETCMSLAS	QVVKLTKQLK	EQTVERVTLQ	NQLQQFLEAQ
KSEGKSLPSS	PSSPSSPASR	KSQWKSPDAD	DDSVAKSKPG	VQEGIQVLGS
LSASSRARPK	AKDEDSDKIL	RQLLGKEISE	NVCTQEKLSL	EFQDAQASSR
NSKKIPLEKR	ELKLARLRQL	MQRSLSESDT	DSNNSEDPKT	TPVRKADRPR
PQPIVESVES	MDSAESLHLM	IKKHTLASGG	RRFPFSIKAS	KSLDGHSPSP
TSESSEPDLE	SQYPGSGSIP	PNQPSGDPQQ	PSPDSTAAQK	VATSPKSALK
SPSSKRRTSQ	NLKLRVTFEE	PVVQMEQPSL	ELNGEKDKDK	GRTLQRTSTS
NESGDQLKRP	FGAFRSIMET	LSGNQNNNNN	YQAANQLKTS	TLPLTSLGRK
TDAKGNPASS	ASKGKNKAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Myhre R., Klungland H., Farrer M.J., Aasly J.O. (2008). Genetic association study of synphilin-1 in idiopathic Parkinson's disease. BMC Med. Genet. 9: 19—19. PMID 18366718 DOI:10.1186/1471-2350-9-19

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11139 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y6H5 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.