SPDEF
SPDEF | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SPDEF, PDEF, bA375E1.3, SAM pointed domain containing ETS transcription factor | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 608144 MGI: 1353422 HomoloGene: 8231 GeneCards: SPDEF | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 34.54 – 34.56 Mb | Хр. 17: 27.93 – 27.95 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
SPDEF (англ. SAM pointed domain containing ETS transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 37 518[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGSASPGLSS | VSPSHLLLPP | DTVSRTGLEK | AAAGAVGLER | RDWSPSPPAT | ||||
PEQGLSAFYL | SYFDMLYPED | SSWAAKAPGA | SSREEPPEEP | EQCPVIDSQA | ||||
PAGSLDLVPG | GLTLEEHSLE | QVQSMVVGEV | LKDIETACKL | LNITADPMDW | ||||
SPSNVQKWLL | WTEHQYRLPP | MGKAFQELAG | KELCAMSEEQ | FRQRSPLGGD | ||||
VLHAHLDIWK | SAAWMKERTS | PGAIHYCAST | SEESWTDSEV | DSSCSGQPIH | ||||
LWQFLKELLL | KPHSYGRFIR | WLNKEKGIFK | IEDSAQVARL | WGIRKNRPAM | ||||
NYDKLSRSIR | QYYKKGIIRK | PDISQRLVYQ | FVHPI |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Yamada N., Tamai Y., Miyamoto H., Nozaki M. (2000). Cloning and expression of the mouse Pse gene encoding a novel Ets family member. Gene. 241: 267—274. PMID 10675039 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00484-9
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chen H., Nandi A.K., Li X., Bieberich C.J. (2002). NKX-3.1 interacts with prostate-derived Ets factor and regulates the activity of the PSA promoter. Cancer Res. 62: 338—340. PMID 11809674
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17257 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O95238 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 6
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |