SWAP70 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SWAP70, SWAP-70, HSPC321, SWAP switching B-cell complex 70kDa subunit, SWAP switching B-cell complex subunit 70, switching B-cell complex subunit switching B cell complex subunit SWAP70 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604762 MGI: 1298390 HomoloGene: 7557 GeneCards: SWAP70 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • цитоскелет • клітинне ядро • lamellipodium • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • positive regulation of mast cell chemotaxis • negative regulation of peptidyl-serine dephosphorylation • negative regulation of actin filament depolymerization • actin filament bundle assembly • regulation of protein localization • regulation of actin polymerization or depolymerization • somatic cell DNA recombination • Перемикання класу імуноглобулінів • positive regulation of actin filament bundle assembly • negative regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 9.66 – 9.75 Mb | Хр. 7: 109.82 – 109.88 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SWAP70 (англ. SWAP switching B-cell complex subunit 70) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 585 амінокислот, а молекулярна маса — 68 998[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGSLKEELLK | | AIWHAFTALD | | QDHSGKVSKS | | QLKVLSHNLC | | TVLKVPHDPV |
ALEEHFRDDD | | EGPVSNQGYM | | PYLNRFILEK | | VQDNFDKIEF | | NRMCWTLCVK |
KNLTKNPLLI | | TEEDAFKIWV | | IFNFLSEDKY | | PLIIVSEEIE | | YLLKKLTEAM |
GGGWQQEQFE | | HYKINFDDSK | | NGLSAWELIE | | LIGNGQFSKG | | MDRQTVSMAI |
NEVFNELILD | | VLKQGYMMKK | | GHRRKNWTER | | WFVLKPNIIS | | YYVSEDLKDK |
KGDILLDENC | | CVESLPDKDG | | KKCLFLVKCF | | DKTFEISASD | | KKKKQEWIQA |
IHSTIHLLKL | | GSPPPHKEAR | | QRRKELRKKQ | | LAEQEELERQ | | MKELQAANES |
KQQELEAVRK | | KLEEAASRAA | | EEEKKRLQTQ | | VELQARFSTE | | LEREKLIRQQ |
MEEQVAQKSS | | ELEQYLQRVR | | ELEDMYLKLQ | | EALEDERQAR | | QDEETVRKLQ |
ARLLEEESSK | | RAELEKWHLE | | QQQAIQTTEA | | EKQELENQRV | | LKEQALQEAM |
EQLEQLELER | | KQALEQYEEV | | KKKLEMATNK | | TKSWKDKVAH | | HEGLIRLIEP |
GSKNPHLITN | | WGPAAFTEAE | | LEEREKNWKE | | KKTTE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Rapalus L., Minegishi Y., Lavoie A., Cunningham-Rundles C., Conley M.E. (2001). Analysis of SWAP-70 as a candidate gene for non-X-linked hyper IgM syndrome and common variable immunodeficiency. Clin. Immunol. 101: 270—275. PMID 11726218 DOI:10.1006/clim.2001.5116
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17070 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UH65 (англ.) . Архів оригіналу за 8 травня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |