TGM2

TGM2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4PYG, 1KV3, 2Q3Z, 3LY6, 3S3J, 3S3P, 3S3S

Ідентифікатори
Символи TGM2, G-ALPHA-h, GNAH, HEL-S-45, TG2, TGC, TG(C), transglutaminase 2, G(h), hTG2, tTG
Зовнішні ІД OMIM: 190196 MGI: 98731 HomoloGene: 3391 GeneCards: TGM2
Онтологія гена
Молекулярна функція

transferase activity
acyltransferase activity
protein-glutamine gamma-glutamyltransferase activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
зв'язування з іоном металу
GTP binding
protein domain specific binding

Клітинна компонента

цитоплазма
intrinsic component of plasma membrane
гіалоплазма
екзосома
focal adhesion
мітохондрія
ендоплазматичний ретикулум
клітинна мембрана
GO:0005578 Позаклітинна матриця
collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

apoptotic cell clearance
phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway
salivary gland cavitation
negative regulation of endoplasmic reticulum calcium ion concentration
positive regulation of mitochondrial calcium ion concentration
GO:0051357, GO:0051358, GO:0051359 peptide cross-linking
positive regulation of cell adhesion
branching involved in salivary gland morphogenesis
positive regulation of inflammatory response
positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
positive regulation of cytosolic calcium ion concentration involved in phospholipase C-activating G protein-coupled signaling pathway
isopeptide cross-linking via N6-(L-isoglutamyl)-L-lysine
positive regulation of apoptotic process
protein homooligomerization
positive regulation of smooth muscle cell proliferation
blood vessel remodeling

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7052
21817
Ensembl
ENSG00000198959
ENSMUSG00000037820
UniProt
P21980
P21981
RefSeq (мРНК)
NM_004613
NM_198951
NM_001323316
NM_001323317
NM_001323318
NM_009373
RefSeq (білок)
NP_001310245
NP_001310246
NP_001310247
NP_004604
NP_945189
NP_033399
Локус (UCSC) Хр. 20: 38.13 – 38.17 Mb Хр. 2: 157.96 – 157.99 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TGM2 (англ. Transglutaminase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 687 амінокислот, а молекулярна маса — 77 329[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAEELVLERCDLELETNGRDHHTADLCREKLVVRRGQPFWLTLHFEGRNY
EASVDSLTFSVVTGPAPSQEAGTKARFPLRDAVEEGDWTATVVDQQDCTL
SLQLTTPANAPIGLYRLSLEASTGYQGSSFVLGHFILLFNAWCPADAVYL
DSEEERQEYVLTQQGFIYQGSAKFIKNIPWNFGQFEDGILDICLILLDVN
PKFLKNAGRDCSRRSSPVYVGRVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNNYGDGVS
PMSWIGSVDILRRWKNHGCQRVKYGQCWVFAAVACTVLRCLGIPTRVVTN
YNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEIQGDKSEMIWNFHCWVESWMTRPDLQPG
YEGWQALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTKYDAPFVFAEVNAD
VVDWIQQDDGSVHKSINRSLIVGLKISTKSVGRDEREDITHTYKYPEGSS
EEREAFTRANHLNKLAEKEETGMAMRIRVGQSMNMGSDFDVFAHITNNTA
EEYVCRLLLCARTVSYNGILGPECGTKYLLNLNLEPFSEKSVPLCILYEK
YRDCLTESNLIKVRALLVEPVINSYLLAERDLYLENPEIKIRILGEPKQK
RKLVAEVSLQNPLPVALEGCTFTVEGAGLTEEQKTVEIPDPVEAGEEVKV
RMDLLPLHMGLHKLVVNFESDKLKAVKGFRNVIIGPA

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.

Література

  • Fraij B.M., Gonzales R.A. (1996). A third human tissue transglutaminase homologue as a result of alternative gene transcripts. Biochim. Biophys. Acta. 1306: 63—74. PMID 8611626 DOI:10.1016/0167-4781(95)00219-7
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Pinkas D.M., Strop P., Brunger A.T., Khosla C. (2007). Transglutaminase 2 undergoes a large conformational change upon activation. PLoS Biol. 5: E327—E327. PMID 18092889 DOI:10.1371/journal.pbio.0050327
  • Fraij B.M., Birckbichler P.J., Patterson M.K. Jr., Lee K.N., Gonzales R.A. (1992). A retinoic acid-inducible mRNA from human erythroleukemia cells encodes a novel tissue transglutaminase homologue. J. Biol. Chem. 267: 22616—22623. PMID 1358880

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11778 (англ.) . Архів оригіналу за 15 листопада 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, P21980 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.