TRIM21 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRIM21, RNF81, RO52, Ro/SSA, SSA, SSA1, tripartite motif containing 21, Tripartite motif-containing protein 21 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 109092 MGI: 106657 HomoloGene: 2365 GeneCards: TRIM21 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • identical protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • SCF ubiquitin ligase complex • P-body • внутрішньоклітинний • autophagosome • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of protein deubiquitination • response to interferon-gamma • positive regulation of autophagy • interferon-gamma-mediated signaling pathway • protein trimerization • positive regulation of viral entry into host cell • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein monoubiquitination • regulation of type I interferon production • positive regulation of cell cycle • protein destabilization • Убіквітин-залежний протеоліз • клітинний цикл • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • protein autoubiquitination • вроджений імунітет • protein polyubiquitination • negative regulation of viral transcription |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 4.38 – 4.39 Mb | Хр. 7: 102.21 – 102.21 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRIM21 (англ. Tripartite motif containing 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 54 170[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASAARLTMM | | WEEVTCPICL | | DPFVEPVSIE | | CGHSFCQECI | | SQVGKGGGSV |
CPVCRQRFLL | | KNLRPNRQLA | | NMVNNLKEIS | | QEAREGTQGE | | RCAVHGERLH |
LFCEKDGKAL | | CWVCAQSRKH | | RDHAMVPLEE | | AAQEYQEKLQ | | VALGELRRKQ |
ELAEKLEVEI | | AIKRADWKKT | | VETQKSRIHA | | EFVQQKNFLV | | EEEQRQLQEL |
EKDEREQLRI | | LGEKEAKLAQ | | QSQALQELIS | | ELDRRCHSSA | | LELLQEVIIV |
LERSESWNLK | | DLDITSPELR | | SVCHVPGLKK | | MLRTCAVHIT | | LDPDTANPWL |
ILSEDRRQVR | | LGDTQQSIPG | | NEERFDSYPM | | VLGAQHFHSG | | KHYWEVDVTG |
KEAWDLGVCR | | DSVRRKGHFL | | LSSKSGFWTI | | WLWNKQKYEA | | GTYPQTPLHL |
QVPPCQVGIF | | LDYEAGMVSF | | YNITDHGSLI | | YSFSECAFTG | | PLRPFFSPGF |
NDGGKNTAPL | | TLCPLNIGSQ | | GSTDY |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, цитоплазматичних везикулах.
Література
- Itoh K., Itoh Y., Frank M.B. (1991). Protein heterogeneity in the human Ro/SSA ribonucleoproteins. The 52- and 60-kD Ro/SSA autoantigens are encoded by separate genes. J. Clin. Invest. 87: 177—186. PMID 1985094 DOI:10.1172/JCI114968
- Chan E.K., Hamel J.C., Buyon J.P., Tan E.M. (1991). Molecular definition and sequence motifs of the 52-kD component of human SS-A/Ro autoantigen. J. Clin. Invest. 87: 68—76. PMID 1985112 DOI:10.1172/JCI115003
- Tsugu H., Horowitz R., Gibson N., Frank M.B. (1994). The location of a disease-associated polymorphism and genomic structure of the human 52-kDa Ro/SSA locus (SSA1). Genomics. 24: 541—548. PMID 7713506 DOI:10.1006/geno.1994.1664
- Keech C.L., Gordon T.P., McCluskey J. (1996). Structural differences between the human and mouse 52-kD Ro autoantigens associated with poorly conserved autoantibody activity across species. Clin. Exp. Immunol. 104: 255—263. PMID 8625517 DOI:10.1046/j.1365-2249.1996.16726.x
- Bepler G., O'Briant K.C., Kim Y.-C., Schreiber G., Pitterle D.M. (1999). A 1.4-Mb high-resolution physical map and contig of chromosome segment 11p15.5 and genes in the LOH11A metastasis suppressor region. Genomics. 55: 164—175. PMID 9933563 DOI:10.1006/geno.1998.5659
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11312 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P19474 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |