TRIM27

Ідентифікатори

Символи

TRIM27, RFP, RNF76, tripartite motif containing 27

Зовнішні ІД

OMIM: 602165 MGI: 97904 HomoloGene: 111010 GeneCards: TRIM27

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • identical protein binding • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • SUMO transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ендосома • PML body • ядерна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • retromer complex • early endosome • клітинне ядро • fibrillar center • ядерце • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of adaptive immune response • negative regulation of protein kinase activity • protein K63-linked ubiquitination • protein trimerization • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • negative regulation of calcium ion import • negative regulation of gene expression, epigenetic • retrograde transport, endosome to Golgi • Сперматогенез • Arp2/3 complex-mediated actin nucleation • negative regulation of tumor necrosis factor production • проліферація • peptidyl-tyrosine phosphorylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of viral transcription • вроджений імунітет • positive regulation of actin nucleation • protein sumoylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5987


19720

Ensembl

ENSG00000229006 ENSG00000233948 ENSG00000204713 ENSG00000215641 ENSG00000237071
ENSG00000237462 ENSG00000234495


ENSMUSG00000021326

UniProt


P14373


Q62158

RefSeq (мРНК)


NM_030950 NM_006510


NM_009054

RefSeq (білок)


NP_006501


NP_033080

Локус (UCSC)

Хр. 6: 28.9 – 28.92 Mb

Хр. 13: 21.36 – 21.38 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM27 (англ. Tripartite motif containing 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 513 амінокислот, а молекулярна маса — 58 490^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASGSVAECL	QQETTCPVCL	QYFAEPMMLD	CGHNICCACL	ARCWGTAETN
VSCPQCRETF	PQRHMRPNRH	LANVTQLVKQ	LRTERPSGPG	GEMGVCEKHR
EPLKLYCEED	QMPICVVCDR	SREHRGHSVL	PLEEAVEGFK	EQIQNQLDHL
KRVKDLKKRR	RAQGEQARAE	LLSLTQMERE	KIVWEFEQLY	HSLKEHEYRL
LARLEELDLA	IYNSINGAIT	QFSCNISHLS	SLIAQLEEKQ	QQPTRELLQD
IGDTLSRAER	IRIPEPWITP	PDLQEKIHIF	AQKCLFLTES	LKQFTEKMQS
DMEKIQELRE	AQLYSVDVTL	DPDTAYPSLI	LSDNLRQVRY	SYLQQDLPDN
PERFNLFPCV	LGSPCFIAGR	HYWEVEVGDK	AKWTIGVCED	SVCRKGGVTS
APQNGFWAVS	LWYGKEYWAL	TSPMTALPLR	TPLQRVGIFL	DYDAGEVSFY
NVTERCHTFT	FSHATFCGPV	RPYFSLSYSG	GKSAAPLIIC	PMSGIDGFSG
HVGNHGHSME	TSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендосомах.

Література

Takahashi M., Inaguma Y., Hiai H., Hirose F. (1988). Developmentally regulated expression of a human 'finger'-containing gene encoded by the 5' half of the ret transforming gene. Mol. Cell. Biol. 8: 1853—1856. PMID 3380101 DOI:10.1128/MCB.8.4.1853
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Takahashi M., Cooper G.M. (1987). ret transforming gene encodes a fusion protein homologous to tyrosine kinases. Mol. Cell. Biol. 7: 1378—1385. PMID 3037315 DOI:10.1128/MCB.7.4.1378
Shimono Y., Murakami H., Hasegawa Y., Takahashi M. (2000). RET finger protein is a transcriptional repressor and interacts with enhancer of polycomb that has dual transcriptional functions. J. Biol. Chem. 275: 39411—39419. PMID 10976108 DOI:10.1074/jbc.M006585200
Tezel G., Nagasaka T., Shimono Y., Takahashi M. (2002). Differential expression of RET finger protein in testicular germ cell tumors. Pathol. Int. 52: 623—627. PMID 12445133 DOI:10.1046/j.1440-1827.2002.01401.x
Dho S.H., Kwon K.S. (2003). The Ret finger protein induces apoptosis via its RING finger-B box-coiled-coil motif. J. Biol. Chem. 278: 31902—31908. PMID 12807881 DOI:10.1074/jbc.M304062200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9975 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P14373 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.