TRIM63

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3DDT, 4M3L, 2D8U

Ідентифікатори

Символи

TRIM63, IRF, MURF1, MURF2, RNF28, SMRZ, tripartite motif containing 63

Зовнішні ІД

OMIM: 606131 MGI: 2447992 HomoloGene: 41878 GeneCards: TRIM63

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • titin binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • M band • contractile fiber • Z discdkac • мікротрубочка • клітинне ядро • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• skeletal muscle atrophy • м'язове скорочення • response to glucocorticoid • response to interleukin-1 • Убіквітин-залежний протеоліз • response to electrical stimulus involved in regulation of muscle adaptation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84676


433766

Ensembl


ENSG00000158022


ENSMUSG00000028834

UniProt


Q969Q1


Q38HM4

RefSeq (мРНК)


NM_032588


NM_001039048 NM_001369245

RefSeq (білок)


NP_115977


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 26.05 – 26.07 Mb

Хр. 4: 134.04 – 134.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM63 (англ. Tripartite motif containing 63) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 353 амінокислот, а молекулярна маса — 40 248^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDYKSSLIQD	GNPMENLEKQ	LICPICLEMF	TKPVVILPCQ	HNLCRKCAND
IFQAANPYWT	SRGSSVSMSG	GRFRCPTCRH	EVIMDRHGVY	GLQRNLLVEN
IIDIYKQECS	SRPLQKGSHP	MCKEHEDEKI	NIYCLTCEVP	TCSMCKVFGI
HKACEVAPLQ	SVFQGQKTEL	NNCISMLVAG	NDRVQTIITQ	LEDSRRVTKE
NSHQVKEELS	QKFDTLYAIL	DEKKSELLQR	ITQEQEKKLS	FIEALIQQYQ
EQLDKSTKLV	ETAIQSLDEP	GGATFLLTAK	QLIKSIVEAS	KGCQLGKTEQ
GFENMDFFTL	DLEHIADALR	AIDFGTDEEE	EEFIEEEDQE	EEESTEGKEE
GHQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, м'язових білків. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Є маркером м'язової атрофії^[5].

Література

Dai K.-S., Liew C.-C. (2001). A novel human striated muscle RING zinc finger protein, SMRZ, interacts with SMT3b via its RING domain. J. Biol. Chem. 276: 23992—23999. PMID 11283016 DOI:10.1074/jbc.M011208200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
McElhinny A.S., Kakinuma K., Sorimachi H., Labeit S., Gregorio C.C. (2002). Muscle-specific RING finger-1 interacts with titin to regulate sarcomeric M-line and thick filament structure and may have nuclear functions via its interaction with glucocorticoid modulatory element binding protein-1. J. Cell Biol. 157: 125—136. PMID 11927605 DOI:10.1083/jcb.200108089

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16007 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q969Q1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ Bodine, Sue C.; Baehr, Leslie M. (2014). Skeletal muscle atrophy and the E3 ubiquitin ligases MuRF1 and MAFbx/atrogin-1. American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism. 307 (6): E469—E484. doi:10.1152/ajpendo.00204.2014. ISSN 0193-1849.(англ.)