TRIM68 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TRIM68

Ідентифікатори

Символи

TRIM68, GC109, RNF137, SS-56, SS56, tripartite motif containing 68

Зовнішні ІД

OMIM: 613184 MGI: 2142077 HomoloGene: 9991 GeneCards: TRIM68

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • androgen receptor binding • histone acetyltransferase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • комплекс Ґольджі • ядерце • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• interferon-gamma-mediated signaling pathway • regulation of androgen receptor signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • protein autoubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55128


101700

Ensembl


ENSG00000167333


ENSMUSG00000073968

UniProt


Q6AZZ1


Q8K243

RefSeq (мРНК)


NM_018073 NM_001304496


NM_198012 NM_001307998

RefSeq (білок)


NP_001291425 NP_060543


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 11: 4.6 – 4.61 Mb

Хр. 7: 102.33 – 102.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM68 (англ. Tripartite motif containing 68) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 56 259^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDPTALVEAI	VEEVACPICM	TFLREPMSID	CGHSFCHSCL	SGLWEIPGES
QNWGYTCPLC	RAPVQPRNLR	PNWQLANVVE	KVRLLRLHPG	MGLKGDLCER
HGEKLKMFCK	EDVLIMCEAC	SQSPEHEAHS	VVPMEDVAWE	YKWELHEALE
HLKKEQEEAW	KLEVGERKRT	ATWKIQVETR	KQSIVWEFEK	YQRLLEKKQP
PHRQLGAEVA	AALASLQREA	AETMQKLELN	HSELIQQSQV	LWRMIAELKE
RSQRPVRWML	QDIQEVLNRS	KSWSLQQPEP	ISLELKTDCR	VLGLREILKT
YAADVRLDPD	TAYSRLIVSE	DRKRVHYGDT	NQKLPDNPER	FYRYNIVLGS
QCISSGRHYW	EVEVGDRSEW	GLGVCKQNVD	RKEVVYLSPH	YGFWVIRLRK
GNEYRAGTDE	YPILSLPVPP	RRVGIFVDYE	AHDISFYNVT	DCGSHIFTFP
RYPFPGRLLP	YFSPCYSIGT	NNTAPLAICS	LDGED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21161 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q6AZZ1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.